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Enregistrement W2623990143 · doi:10.1098/rsif.2017.0071

Mitochondrial DNA 3243A>G heteroplasmy is associated with changes in cytoskeletal protein expression and cell mechanics

2017· article· en· W2623990143 sur OpenAlexfundno aff
Judith Kandel, Martin Picard, Douglas C. Wallace, David M. Eckmann

Notice bibliographique

RevueJournal of The Royal Society Interface · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesOffice of Naval Research GlobalNational Institute of Neurological Disorders and StrokeCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteSimons Foundation
Mots-clésHeteroplasmyCytoskeletonMitochondrial DNACell biologyDNABiologyProtein expressionCellGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondrial and mechanical alterations in cells have both been shown to be hallmarks of human disease. However, little research has endeavoured to establish connections between these two essential features of cells in both functional and dysfunctional situations. In this work, we hypothesized that a specific genetic alteration in mitochondrial function known to cause human disease would trigger changes in cell mechanics. Using a previously characterized set of mitochondrial cybrid cell lines, we examined the relationship between heteroplasmy for the mitochondrial DNA (mtDNA) 3243A>G mutation, the cell cytoskeleton, and resulting cellular mechanical properties. We found that cells with increasing mitochondrial dysfunction markedly differed from one another in gene expression and protein production of various co-regulated cytoskeletal elements. The intracellular positioning and organization of actin also differed across cell lines. To explore the relationship between these changes and cell mechanics, we then measured cellular mechanical properties using atomic force microscopy and found that cell stiffness correlated with gene expression data for known determinants of cell mechanics, γ-actin, α-actinin and filamin A. This work points towards a mechanism linking mitochondrial genetics to single-cell mechanical properties. The transcriptional and structural regulation of cytoskeletal components by mitochondrial function may explain why energetic and mechanical alterations often coexist in clinical conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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