Hyperbiofilm phenotype of <i>Pseudomonas aeruginosa</i> defective for the PlcB and PlcN secreted phospholipases
Notice bibliographique
Résumé
Biofilms are dense communities of bacteria enmeshed in a protective extracellular matrix composed mainly of exopolysaccharides, extracellular DNA, proteins, and outer membrane vesicles (OMVs). Given the role of biofilms in antibiotic-tolerant and chronic infections, novel strategies are needed to block, disperse, or degrade biofilms. Enzymes that degrade the biofilm matrix are a promising new therapy. We screened mutants in many of the enzymes secreted by the type II secretion system (T2SS) and determined that the T2SS, and specifically phospholipases, play a role in biofilm formation. Mutations in the xcp secretion system and in the plcB and plcN phospholipases all resulted in hyperbiofilm phenotypes. PlcB has activity against many phospholipids, including the common bacterial membrane lipid phosphatidylethanolamine, and may degrade cell membrane debris or OMVs in the biofilm matrix. Exogenous phospholipase was shown to reduce aggregation and biofilm formation, suggesting its potential role as a novel enzymatic treatment to dissolve biofilms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».