MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2624957041 · doi:10.1016/j.ebiom.2017.06.012

The NOD2 -Smoking Interaction in Crohn's Disease is likely Specific to the 1007 fs Mutation and may be Explained by Age at Diagnosis: A Meta-Analysis and Case-Only Study

2017· review· en· W2624957041 sur OpenAlexafffund
M Ellen Kuenzig, Jeffrey Yim, Stephanie Coward, Bertus Eksteen, Cynthia H. Seow, Cheryl Barnabé, Herman W. Barkema, Mark S. Silverberg, Péter L. Lakatos, Paul L. Beck, Richard N. Fedorak, Levinus A. Dieleman, Karen Madsen, Remo Panaccione, Subrata Ghosh, Gilaad G. Kaplan

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensUniversity of AlbertaMontreal General HospitalUniversity of TorontoMount Sinai HospitalUniversity of British ColumbiaMcGill UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchAlberta InnovatesIndian Institute of Technology BombayUniversity of AlbertaUniversity of Calgary
Mots-clésNOD2MedicineOdds ratioCrohn's diseaseInternal medicineMeta-analysisDiseaseConfidence intervalGastroenterology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: NOD2 and smoking are risk factors for Crohn's disease. We meta-analyzed NOD2-smoking interactions in Crohn's disease (Phase 1), then explored the effect of age at diagnosis on NOD2-smoking interactions (Phase 2). METHODS: Phase 1: MEDLINE and EMBASE were searched for studies (n=18) providing data on NOD2 and smoking in Crohn's disease. NOD2-smoking interactions were estimated using odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) calculated using random effects models. Phase 2: A case-only study compared the proportion of smokers and carriers of the 1007fs variant across ages at diagnosis (≤16, 17-40, >40years). FINDINGS: Phase 1: Having ever smoked was less common among carriers of the 1007fs variant of NOD2 (OR 0.74, 95%CI:0.66-0.83). There was no interaction between smoking and the G908R (OR 0.96, 95%CI:0.82-1.13) or the R702W variant (OR 0.89, 95%CI:0.76-1.05). Phase 2: The proportion of patients (n=627) carrying the 1007fs variant decreased with age at diagnosis (≤16years: 15%; 17-40: 12%; >40: 3%; p=0.003). Smoking was more common in older patients (≤16years: 4%; 17-40: 48%; >40: 71%; p<0.001). INTERPRETATION: The negative NOD2-smoking interaction in Crohn's disease is specific to the 1007fs variant. However, opposing rates of this variant and smoking across age at diagnosis may explain this negative interaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,019
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,033
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,102

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0190,033
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0090,052
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,081
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEBioMedicineMême sujetInflammatory Bowel DiseaseTravaux en français237 207