Bacteria defend against phages through type IV pilus glycosylation
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Bacterial surface structures such as type IV pili are common receptors for phage. Strains of the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa express one of five different major type IV pilin alleles, two of which are glycosylated with either lipopolysaccharide O-antigen units or polymers of D-arabinofuranose. Here we show that both these post-translational modifications protect P. aeruginosa from a variety of pilus-specific phages. We identified a phage capable of infecting strains expressing both non-glycosylated and glycosylated pilins, and through construction of a chimeric phage, traced this ability to its unique tail proteins. Alteration of pilin sequence, or masking of binding sites by glycosylation, both block phage infection. The energy invested by prokaryotes in glycosylating thousands of pilin subunits is thus explained by the protection against phage predation provided by these common decorations. SIGNIFICANCE Post-translational modification of bacterial and archaeal surface structures such as pili and flagella is widespread, but the function of these decorations is not clear. We propose that predation by bacteriophages that use these structures as receptors selects for strains that mask potential phage binding sites using glycosylation. Phages are of significant interest as alternative treatments for antibiotic-resistant pathogens, but the ways in which phage interact with host receptors are not well understood. We show that specific phage tail proteins allow for infection of strains with glycosylated pili, providing a foundation for the creation of designer phages that can circumvent first-line bacterial defenses.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».