Evolution of strigolactone receptors by gradual neo-functionalization of KAI2 paralogues
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Strigolactones (SLs) are a class of plant hormones that control many aspects of plant growth. The SL signalling mechanism is homologous to that of karrikins (KARs), smoke-derived compounds that stimulate seed germination. In angiosperms, the SL receptor is an α/β-hydrolase known as DWARF14 (D14); its close homologue, KARRIKIN INSENSITIVE2 (KAI2), functions as a KAR receptor and likely recognizes an uncharacterized, endogenous signal ('KL'). Previous phylogenetic analyses have suggested that the KAI2 lineage is ancestral in land plants, and that canonical D14-type SL receptors only arose in seed plants; this is paradoxical, however, as non-vascular plants synthesize and respond to SLs. RESULTS: We have used a combination of phylogenetic and structural approaches to re-assess the evolution of the D14/KAI2 family in land plants. We analysed 339 members of the D14/KAI2 family from land plants and charophyte algae. Our phylogenetic analyses show that the divergence between the eu-KAI2 lineage and the DDK (D14/DLK2/KAI2) lineage that includes D14 occurred very early in land plant evolution. We show that eu-KAI2 proteins are highly conserved, and have unique features not found in DDK proteins. Conversely, we show that DDK proteins show considerable sequence and structural variation to each other, and lack clearly definable characteristics. We use homology modelling to show that the earliest members of the DDK lineage structurally resemble KAI2 and that SL receptors in non-seed plants likely do not have D14-like structure. We also show that certain groups of DDK proteins lack the otherwise conserved MORE AXILLARY GROWTH2 (MAX2) interface, and may thus function independently of MAX2, which we show is highly conserved throughout land plant evolution. CONCLUSIONS: Our results suggest that D14-like structure is not required for SL perception, and that SL perception has relatively relaxed structural requirements compared to KAI2-mediated signalling. We suggest that SL perception gradually evolved by neo-functionalization within the DDK lineage, and that the transition from KAI2-like to D14-like protein may have been driven by interactions with protein partners, rather than being required for SL perception per se.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle