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Enregistrement W2625556963 · doi:10.1111/jam.13509

Metabolic defence against oxidative stress: the road less travelled so far

2017· review· en· W2625556963 sur OpenAlexafffund
Joseph Lemire, Azhar Alhasawi, Vasu D. Appanna, Sujeenthar Tharmalingam

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRedox biology and oxidative stress
Établissements canadiensLaurentian UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesLaurentian UniversityCanadian International Development AgencyInternational Science and Technology CenterNorth Atlantic Treaty Organization
Mots-clésReactive oxygen speciesBiochemistryOxidative stressGlutathioneMetaboliteChemistryMetabolic pathwayMetabolismEnzymeCatalaseOxidative phosphorylationSuperoxide dismutaseMitochondrial ROSContext (archaeology)Biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

). They are known to evoke intricate strategies to defend themselves from the reactive by-products of oxygen-reactive oxygen species (ROS). Many of these detoxifying mechanisms have been extensively characterized; superoxide dismutase, catalases, alkyl hydroperoxide reductase and the glutathione (GSH)-cycling system are responsible for neutralizing specific ROS. Meanwhile, a pool of NADPH-the reductive engine of many ROS-combating enzymes-is maintained by metabolic enzymes including, but not exclusively, glucose-6 phosphate dehydrogenase (G6PDH) and NADP-dependent isocitrate dehydrogenase (ICDH-NADP). So, it is not surprising that evidence continues to emerge demonstrating the pivotal role metabolism plays in mitigating ROS toxicity. Stemming from its ability to concurrently decrease the production of the pro-oxidative metabolite, NADH, while augmenting the antioxidative metabolite, NADPH, metabolism is the fulcrum of cellular redox potential. In this review, we will discuss the mounting evidence positioning metabolism and metabolic shifts observed during oxidative stress, as critical strategies microbes utilize to thrive in environments that are rife with ROS. The contribution of ketoacids-moieties capable of non-enzymatic decarboxylation in the presence of oxidants-as ROS scavengers will be elaborated alongside the metabolic pathways responsible for their homeostases. Further, the signalling role of the carboxylic acids generated following the ketoacid-mediated detoxification of the ROS will be commented on within the context of oxidative stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,027

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,005
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations145
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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