Multi-institutional comparison of breast cancer risk stratification by 70-gene signature and 21-gene assay.
Notice bibliographique
Résumé
522 Background: Breast cancer risk stratification with the 70-gene signature (70-GS) provides a binary low risk (LR) or high risk (HR) result; by contrast the 21-gene assay (21-GA) provides LR, intermediate (IR), and HR results. Results from these two assays were compared for 769 patients from 5 institutions. Methods: The study included patients from McGill University (n = 86), UPMC (n = 437), USF (n = 135), Morton Plant North Bay Hospital (n = 79), and Cleveland Clinic (n = 32, all 21-GA IR). Results: With the 70-GS, 487 (63%) patients had a LR and 282 (37%) patients had a HR result. Excluding 32 cases selected for 21-GA IR results (n = 737), the 21-GA gave 369 (50%), 250 (34%), and 118 (16%) patients with LR, IR, and HR scores, respectively. Using the TAILORx cutoff, there were 134 (18%), 432 (59%), and 171 (23%) patients with LR, IR, and HR scores, respectively. There were 329 (45%) and 486 (66%) patients who were not classified in the same risk category by both assays using the clinical and TAILORx cutoffs for IR, respectively. Conclusions: In a large multi-institutional study the 70-GS and 21-GA results were discordant in 45-66% of patients, and the proportion of patients with a 21-GA score in the IR range varied from 34-59%. The 70-GS provided clinically actionable results for all patients. [Table: see text]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».