Diagnostic and phylogenetic utility of the first DNA barcode library for longhorn beetles (Coleoptera: Cerambycidae) from the Russian Far East
Notice bibliographique
Résumé
One hundred forty two specimens representing 56 species of longhorn beetles (Cerambycidae) from the Russian Far East were sequenced for a 658 bp fragment of the 5' end of the mitochondrial cytochrome oxidase subunit I gene (COI, =DNA barcode). The data are publicly available in an open access online library (dx.doi.org/10.5883/DS-CERRF). All analysed species could be differentiated using the standard online DNA barcode identification tool, except for a group of three sympatric colour-defined Menesia species. Seven Menesia records share the same Barcode Identification Number (=BIN), while the single specimen of M. flavotecta shares the same haplotype as some of M. sulphurata. Excluding the Menesia case, the Barcode Index Numbers (BINs) uniquely correspond to the analysed species, in all but the four specimens of Chlorophorus simillimus where they share two BINs. Although DNA barcoding aims to develop species identification systems, some phylogenetic signal was apparent in the data and in the Maximum Likelihood analysis, all four subfamilies were recovered as monophyletic. Notwithstanding the few detected deviations from the absolute taxonomic/phylogenetic match, DNA barcoding is a powerful identification tool with a capacity to place an undocumented record among its closest relatives.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».