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Enregistrement W2626463613 · doi:10.1101/147397

Genome-wide association study of Alcohol Use Disorder Identification Test (AUDIT) scores in 20,328 research participants of European ancestry

2017· preprint· en· W2626463613 sur OpenAlexaff
Pierre Fontanillas, Sarah L. Elson, Joshua C. Gray, Harriet de Wit, Lea K. Davis, James MacKillop, Abraham A. Palmer

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlcohol Consumption and Health Effects
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare HamiltonHomewood Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlcohol Use Disorders Identification TestGenome-wide association studyAlcohol use disorderHeritabilityGenetic associationMedicineAlcohol dependenceGenetic correlationPopulationAuditPsychiatryAlcohol consumptionPsychologyGeneticsAlcoholBiologyGenetic variationGenotypeGeneEnvironmental healthSingle-nucleotide polymorphism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Genetic factors contribute to the risk for developing alcohol use disorder ( AUD ). In collaboration with the genetics company 23andMe, Inc., we performed a genome-wide association ( GWAS ) study of the Alcohol Use Disorder Identification Test ( AUDIT ), an instrument designed to screen for alcohol misuse over the past year. Our final sample consisted of 20,328 research participants of European ancestry (55.3% females; mean age = 53.8, SD = 16.1) who reported ever using alcohol. Our results showed that the ‘chip-heritability’ of AUDIT score, when treated as a continuous phenotype, was 12%. No loci reached genome-wide significance. The gene ADH1C , which has been previously implicated in AUD, was among our most significant associations (4.4 × 10 −7 ; rs141973904). We also detected a suggestive association on chromosome 1 (2.1 × 10 −7 ; rs182344113) near the gene KCNJ9 , which has been implicated in mouse models of high ethanol drinking. Using LD score regression, we identified positive genetic correlations between AUDIT score and AUD, high alcohol consumption, and cigarette smoking. We also observed an unexpected positive genetic correlation between AUDIT and educational attainment, and additional unexpected negative correlations with BMI/obesity and attention-deficit/hyperactivity disorder ( ADHD ). We conclude that conducting a genetic study using data from a population unselected for AUD and responding to an online questionnaire may represent a cost-effective strategy for elucidating the etiology of AUD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,118
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,210
Tête enseignante GPT0,403
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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