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Enregistrement W2626604457 · doi:10.1038/s41598-017-01674-8

A genome-wide association study of anorexia nervosa suggests a risk locus implicated in dysregulated leptin signaling

2017· article· en· W2626604457 sur OpenAlexaff
Dong Li, Xiao Chang, John J. Connolly, Lifeng Tian, Yichuan Liu, Elizabeth Bhoj, Nora Robinson, Debra Abrams, Leslie A. Lange, Jonathan P. Bradfield, Cecilia E. Kim, Jin Li, Fengxiang Wang, James Snyder, Maria Lemma, Cuiping Hou, Zhi Wei, Yiran Guo, Haijun Qiu, Frank Mentch, Kelly Thomas, Rosetta Chiavacci, Roger D. Cone, Bingshan Li, Patrick Sleiman, Vesna Boraska Perica, Christopher S. Franklin, James Floyd, Laura M. Thornton, Laura M. Huckins, Lorraine Southam, N. William Rayner, Ioanna Tachmazidou, Kelly L. Klump, Janet Treasure, Ulrike Schmidt, Federica Tozzi, Kirsty Kiezebrink, Johannes Hebebrand, Philip Gorwood, Roger A.H. Adan, Martien J. Kas, Angela Favaro, Paolo Santonastaso, Fernando Fernández‐Aranda, Mónica Gratacòs, Filip Rybakowski, Monika Dmitrzak‐Węglarz, Jaakko Kaprio, Anna Keski‐Rahkonen, Anu Raevuori, Eric F. van Furth, M Landt, James I. Hudson, Ted Reichborn‐Kjennerud, Gun Peggy Knudsen, Palmiero Monteleone, Allan S. Kaplan, Andreas Karwautz, Wade H. Berrettini, Nicholas J. Schork, Tetsuya Ando, Hidetoshi Inoko, Tõnu Esko, Krista Fischer, Katrin Männik, Andres Metspalu, Jessica H. Baker, Janiece E. DeSocio, Christopher Hilliard, Julie K. O’Toole, Jacques Pantel, Jin P. Szatkiewicz, Stephanie Zerwas, Oliver S. P. Davis, Sietske G. Helder, Katharina Bühren, Roland Burghardt, Martina de Zwaan, Karin Egberts, Stefan Ehrlich, Beate Herpertz‐Dahlmann, Wolfgang Herzog, Hartmut Imgart, André Scherag, Stephan Zipfel, Claudette Boni, Nicolás Ramoz, Audrey Versini, Unna N. Danner, Judith Hendriks, Bobby P.C. Koeleman, Roel A. Ophoff, Eric Strengman, Annemarie Elburg, Alice Bruson, Maurizio Clementi, Daniela Degortes, Monica Forzan, Elena Tenconi, Elisa Docampo, Geòrgia Escaramís, Susana Jiménez‐Múrcia, Jolanta Lissowska, Andrzej Rajewski, Neonila Szeszenia‐Dąbrowska, Agnieszka Slopien, Joanna Hauser, Leila Karhunen, Ingrid Meulenbelt, P. Eline Slagboom, Alfonso Tortorella, Mario Maj, George Dedoussis, Dimitris Dikeos, Fragiskos Gonidakis, Konstantinos Tziouvas, Άρτεμις Τσίτσικα, Hana Papežová, Lenka Šlachtová, Debora Martaskova, James L. Kennedy, Robert D. Levitan, Zeynep Yılmaz, Julia Huemer, Doris Koubek, Elisabeth Merl, Gudrun Wagner, Paul Lichtenstein, Gerome Breen, Sarah Cohen‐Woods, Anne Farmer, Peter McGuffin, Sven Cichon, Ina Giegling, Stefan Herms, Dan Rujescu, Stefan Schreiber, H-Erich Wichmann, Christian Dina, Robert Sladek, Giovanni Gambaro, Nicole Soranzo, Antonio Julià, Sara Marsal, Raquel Rabionet, Valérie Gaborieau, Danielle M. Dick, Aarno Palotie, Samuli Ripatti, Elisabeth Widén, Ole A. Andreassen, Thomas Espeseth, Astri J. Lundervold, Ivar Reinvang, Vidar M. Steen, Stéphanie Le Hellard, Morten Mattingsdal, Ιωάννα Ντάλλα, Vladimír Bencko, Lenka Foretová, Vladimí­r Janout, Marie Navratilova, Steven Gallinger, Dalila Pinto, Stephen W. Scherer, H.N. Aschauer, Laura Carlberg, Alexandra Schosser, Lars Alfredsson, Bo Ding, Lars Klareskog, Leonid Padyukov, Chris Finan, Gursharan Kalsi, Marion Roberts, Jeff Barrett, Xavier Estivill, Anke Hinney, Patrick F. Sullivan, Eleftheria Zeggini, Cynthia M. Bulik, Harry Brandt, Steve Crawford, Scott J. Crow, Manfred M. Fichter, Katherine A. Halmi, Craig Johnson, Maria C. La Via, James E. Mitchell, Michael Strober, Alessandro Rotondo, D. Blake Woodside, Pamela K. Keel, Lisa Lilenfeld, Andrew W. Bergen, Wade Berrettini, Walter H. Kaye, Pierre J. Magistretti, Håkon Håkonarson

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueRegulation of Appetite and Obesity
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity of TorontoUniversity Health NetworkHospital for Sick ChildrenMcGill University and Génome Québec Innovation CentreLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute of Mental HealthChildren's Hospital of Philadelphia
Mots-clésGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismLocus (genetics)Genetic associationPhenotypeGeneticsBiologyLeptinSNPBioinformaticsGeneEndocrinologyGenotypeObesity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We conducted a genome-wide association study (GWAS) of anorexia nervosa (AN) using a stringently defined phenotype. Analysis of phenotypic variability led to the identification of a specific genetic risk factor that approached genome-wide significance (rs929626 in EBF1 (Early B-Cell Factor 1); P = 2.04 × 10−7; OR = 0.7; 95% confidence interval (CI) = 0.61–0.8) with independent replication (P = 0.04), suggesting a variant-mediated dysregulation of leptin signaling may play a role in AN. Multiple SNPs in LD with the variant support the nominal association. This demonstrates that although the clinical and etiologic heterogeneity of AN is universally recognized, further careful sub-typing of cases may provide more precise genomic signals. In this study, through a refinement of the phenotype spectrum of AN, we present a replicable GWAS signal that is nominally associated with AN, highlighting a potentially important candidate locus for further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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