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Enregistrement W2626683207 · doi:10.1038/s41598-017-03850-2

LNA/DNA mixmer-based antisense oligonucleotides correct alternative splicing of the SMN2 gene and restore SMN protein expression in type 1 SMA fibroblasts

2017· article· en· W2626683207 sur OpenAlexafffund
Aleksander Touznik, Rika Maruyama, Kana Hosoki, Yusuke Echigoya, Toshifumi Yokota

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeurogenetic and Muscular Disorders Research
Établissements canadiensMuscular Dystrophy CanadaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFaculty of Medicine and Dentistry, University of AlbertaMuscular Dystrophy CanadaUniversity of AlbertaCanadian Institutes of Health ResearchWomen and Children's Health Research InstituteChildren's Health Research Institute
Mots-clésSMN1Locked nucleic acidSpinal muscular atrophyExonSMA*OligonucleotideBiologyMolecular biologyMorpholinoExon skippingAlternative splicingRNA splicingSense (electronics)GeneGeneticsRNAGene knockdownChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Spinal muscular atrophy (SMA) is an autosomal recessive disorder affecting motor neurons, and is currently the most frequent genetic cause of infant mortality. SMA is caused by a loss-of-function mutation in the survival motor neuron 1 (SMN1) gene. SMN2 is an SMN1 paralogue, but cannot compensate for the loss of SMN1 since exon 7 in SMN2 mRNA is excluded (spliced out) due to a single C-to-T nucleotide transition in the exon 7. One of the most promising strategies to treat SMA is antisense oligonucleotide (AON)-mediated therapy. AONs are utilized to block intronic splicing silencer number 1 (ISS-N1) on intron 7 of SMN2, which causes exon 7 inclusion of the mRNA and the recovery of the expression of functional SMN protein from the endogenous SMN2 gene. We developed novel locked nucleic acid (LNA)-based antisense oligonucleotides (LNA/DNA mixmers), which efficiently induce exon 7 inclusion in SMN2 and restore the SMN protein production in SMA patient fibroblasts. The mixmers are highly specific to the targeted sequence, and showed significantly higher efficacy than an all-LNA oligonucleotide with the equivalent sequence. These data suggest that use of LNA/DNA mixmer-based AONs may be an attractive therapeutic strategy to treat SMA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,366

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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