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Enregistrement W2626725884 · doi:10.1186/s12870-017-1051-1

Brief temperature stress during reproductive stages alters meiotic recombination and somatic mutation rates in the progeny of Arabidopsis

2017· article· en· W2626725884 sur OpenAlexfundno aff
Ramswaroop Saini, Amit Kumar Singh, Shanmuhapreya Dhanapal, Thoufeequl Hakeem Saeed, Geoffrey J. Hyde, Ramamurthy Baskar

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesWeizmann Institute of ScienceUniversity of California, San DiegoDepartment of Biotechnology, Ministry of Science and Technology, IndiaUniversity of Lethbridge
Mots-clésBiologyArabidopsisMeiosisSomatic cellRecombinationHomologous recombinationGeneticsMutationMutantGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Plants exposed to environmental stresses draw upon many genetic and epigenetic strategies, with the former sometimes modulated by the latter. This can help the plant, and its immediate progeny, at least, to better endure the stress. Some evidence has led to proposals that (epi) genetic changes can be both selective and sustainably heritable, while other evidence suggests that changes are effectively stochastic, and important only because they induce genetic variation. One type of stress with an arguably high level of stochasticity in its effects is temperature stress. Studies of how heat and cold affect the rates of meiotic recombination (MR) and somatic mutations (SMs, which are potentially heritable in plants) report increases, decreases, or no effect. Collectively, they do not point to any consistent patterns. Some of this variability, however, might arise from the stress being applied for such an extended time, typically days or weeks. Here, we adopted a targeted approach by (1) limiting exposure to one hour; and (2) timing it to coincide with (a) gamete, and early gametophyte, development, a period of high stress sensitivity; and (b) a late stage of vegetative development. RESULTS: For plants (Arabidopsis thaliana) otherwise grown at 22 °C, we measured the effects of a 1 h exposure to cold (12 °C) or heat (32 °C) on the rates of MR, and four types of SMs (frameshift mutations; intrachromosomal recombination; base substitutions; transpositions) in the F1 progeny. One parent (wild type) was stressed, the other (unstressed) carried a genetic event detector. When rates were compared to those in progeny of control (both parents unstressed) two patterns emerged. In the progeny of younger plants (stressed at 36 days; pollinated at 40 days) heat and cold either had no effect (on MR) or (for SMs) had effects that were rare and stochastic. In the progeny of older plants (stressed at 41 days; pollinated at 45 days), while effects were also infrequent, those that were seen followed a consistent pattern: rates of all five genetic events were lowest at 12 °C and highest at 32 °C, i.e. they varied in a "dose-response" manner. This pattern was strongest (or, in the case of MR, only apparent) in progeny whose stressed parent was female. CONCLUSION: While the infrequency of effects suggests the need for cautious inference, the consistency of responses in the progeny of older plants, indicate that in some circumstances the level of stochasticity in inherited genetic responses to heat or cold stress can be context-dependent, possibly reflecting life-cycle stages in the parental generation that are variably stress sensitive.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,146
Score d'incertitude au seuil0,289

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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