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Enregistrement W2646106353 · doi:10.1161/str.47.suppl_1.50

Abstract 50: Evaluation of Candidate Polymorphisms for Association With Brain Arteriovenous Malformations and Intracranial Hemorrhage in Hereditary Hemorrhagic Telangiectasia

2016· article· en· W2646106353 sur OpenAlexaff
Ludmila Pawlikowska, Jeffrey Nelson, Diana E. Guo, Charles E. McCulloch, Michael T. Lawton, Helen Kim, Marie E. Faughnan

Notice bibliographique

RevueStroke · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVascular Anomalies and Treatments
Établissements canadiensSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineTelangiectasiaIntracerebral hemorrhageOdds ratioApolipoprotein EHaplotypeGenotypeArteriovenous malformationInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismAlleleGastroenterologyPathologySurgerySubarachnoid hemorrhageGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Brain arteriovenous malformations (AVM) are an important cause of intracranial hemorrhage (ICH) in young adults. Most are sporadic, but also occur in inherited diseases such as hereditary hemorrhagic telangiectasia (HHT). ICH presentation of brain AVM in both sporadic and HHT cases is a marker of high ICH risk. In order to investigate whether the same genetic modifiers influence sporadic and HHT brain AVM, we evaluated candidate genetic polymorphisms reported as associated with sporadic brain AVM, with ICH presentation or ICH during clinical course, in HHT patients. Methods: We genotyped 8 polymorphisms ( APOE E2/3/4 [rs7412, rs429358], ANGPTL rs116724, EPHB4 rs314308, IL6 -174G>C [rs1800795], IL1B -31T>C [rs1143627], ITGB8 rs10486391, TNF -238G>A[rs361525]) in 753 Caucasian HHT patients enrolled by the Brian Vascular Malformation Consortium (BVMC). Genotypes were collapsed into risk allele carriers vs. other for analysis, as published for sporadic AVM. APOE E2/3/4 haplotypes were assigned based on genotypes of the 2 APOE polymorphisms. Association of genotype with phenotype was evaluated by multivariable logistic regression adjusted for age, gender and accounting for family clustering. We used a nominal significance threshold of p=0.05, requiring the same direction of effect as in sporadic brain AVM (odds ratio for risk genotype [OR]>1). Results: Among 753 HHT patients, 155 (21%) had brain AVM, of whom 26 (17%) presented with ICH. Two additional brain AVM patients had ICH during follow-up. None of the 7 variants (6 single nucleotide polymorphisms and APOE haplotype) were significantly associated with brain AVM (OR=0.6-1.3), with ICH presentation of brain AVM (OR=0.4-1.9), or with any brain AVM ICH in HHT patients (OR=0.5-2.1). Conclusions: Common genetic variants previously reported to be associated with sporadic brain AVM were not associated with brain AVM nor with ICH in the BVMC HHT cohort, suggesting different genetic modifiers may influence sporadic and HHT brain AVM. However, the number of ICH cases in the cohort is small, so the confidence intervals are wide and we cannot rule out clinically important associations. The BVMC is enrolling additional HHT patients to expand the cohort and increase power for association analyses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
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