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Enregistrement W2655912491 · doi:10.1111/ocr.12162

The use of cell culture platforms to identify novel markers of bone and dentin resorption

2017· article· en· W2655912491 sur OpenAlexaff
Wellington J. Rody, Oleg V. Krokhin, Victor Spicer, Casey A. Chamberlain, M. Chamberlain, Kevin P. McHugh, Shannon M. Wallet, A. K. Emory, J. D. Crull, L. Shannon Holliday

Notice bibliographique

RevueOrthodontics and Craniofacial Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensResearch Manitoba
Organismes subventionnairesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchAmerican Association of Orthodontists Foundation
Mots-clésMicrovesiclesResorptionIn vitroOsteoclastBiomarkerBone resorptionDentinChemistryExosomeProteomicsIn vitro toxicologyCell biologyCalvariaPathologyBiochemistryBiologyMedicineEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: 1) To test the hypothesis that there would be proteomic differences in the composition of exosomes isolated from osteoclasts and odontoclasts and 2) to determine the clinical usefulness of these in vitro biomarker candidates. MATERIALS AND METHODS: Mouse bone marrow-derived precursors were cultured on either dentin or bone slices and allowed to mature and begin resorption. Exosomes were isolated from cell culture media and characterized by mass spectrometry. The proteomic data obtained from this in vitro study were compared with the data obtained from human samples in our previous work. RESULTS: There was a difference in the proteomic composition of exosomes from osteoclasts and odontoclasts. A total of 40 exosomal proteins were only present in osteoclast media, whereas six unique exosomal proteins were identified in odontoclast supernatants. Approximately 50% of exosomal proteins released by clastic cells in vitro can be found in oral fluids. CONCLUSION: Our data suggest that the mineralized matrix type plays a role in the final phenotypic characteristics of mouse clastic cells. Many in vitro biomarker candidates of bone and dentin resorption can also be found in human oral fluids, thus indicating that this approach may be a viable alternative in biomarker discovery.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,101
Tête enseignante GPT0,391
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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