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Enregistrement W2656010284 · doi:10.1021/acs.biochem.7b00262

A Multimodal Spectroscopic Imaging Method To Characterize the Metal and Macromolecular Content of Proteinaceous Aggregates (“Amyloid Plaques”)

2017· article· en· W2656010284 sur OpenAlexafffund
Kelly L. Summers, Nicholas Fimognari, Ashley Hollings, Mitchell Kiernan, Virginie Lam, Rebecca J. Tidy, David Paterson, Mark J. Tobin, Ryusuke Takechi, Graham N. George, Ingrid J. Pickering, John Mamo, Hugh H. Harris, Mark J. Hackett

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSpectroscopy Techniques in Biomedical and Chemical Research
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesAustralian Research CouncilNational Health and Medical Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCurtin University of TechnologyUniversity of Saskatchewan
Mots-clésMicroscopyRaman spectroscopyAmyloid (mycology)ChemistryPathologyFluorescence microscopeInfrared microscopyCharacterization (materials science)Fourier transform infrared spectroscopyThioflavinFluorescenceBiophysicsBiochemistryAlzheimer's diseaseBiologyMaterials scienceMedicineNanotechnologyChemical engineeringDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alzheimer's disease (AD) is a major international health and economic concern. A key pathological feature of AD is so-called "amyloid-β-plaques", or "Aβ-plaques", which are deposits of aggregated protein, enriched with the Aβ fragment of amyloid precursor protein. Despite their name, the deposits are not pure Aβ and have a heterogeneous, chemically complex composition that can include multiple proteins, lipids, and metal ions (Fe, Cu, or Zn). Despite extensive research, it is still uncertain whether Aβ-plaques are a cause or a consequence of AD pathology. Further characterization of the elemental and biochemical composition within and surrounding Aβ-plaques, and knowledge of how composition varies with disease state or progression, may provide important insight into the relationship between Aβ-plaques and AD pathology. With this aim in mind, herein we demonstrate a multimodal spectroscopic imaging workflow to better characterize the complex composition of Aβ-plaques. Our approach incorporates several spectroscopic imaging techniques, such as Fourier transform infrared spectroscopic imaging (FTIR), Raman microscopy, and X-ray fluorescence microscopy (XFM). While FTIR, Raman, and XFM have been used previously, mostly in isolation, to study Aβ-plaques, application of all three techniques, in combination with histology and fluorescence microscopy, has not been reported previously. We demonstrate that a multimodal workflow, incorporating all three methods on adjacent or serial tissue sections, can reveal substantial complementary information about the biochemical and elemental composition of Aβ-plaques. Information revealed by the method includes the relative content and distribution of aggregated protein, total lipid, lipid esters, cholesterol, and metals (Fe, Cu, or Zn).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,370

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,309 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations69
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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