Screening for Lynch syndrome in unselected women with endometrial cancer.
Notice bibliographique
Résumé
5508 Background: Endometrial cancer (EC) is often the sentinel cancer in women with Lynch Syndrome (LS) however it is often not recognized in this population. A prospective cohort study comparing family history, immunohistochemistry (IHC) for mismatch repair (MMR) proteins, and tumour morphology to germline mutation status in MMR genes was performed in unselected women with EC to determine which screening strategy was superior in identifying women with LS. Methods: All women with newly diagnosed EC between July 2010 and June 2011 were asked to participate in the prospective screening protocol for LS which included completing an extended family history questionnaire (eFHQ), tumor assessment for LS-associated morphologic features and IHC as well as germline mutation testing. Results: 119 (n = 182, 65%) consented to the study. The median age was 61 (26-91), 96 (81%) stage I, and 42 (35%) had high risk histology. There were 6 (7.4%, n = 81) women that were germline mutation positive (MLH1 N=3; MSH6 n = 2; MSH2 n =1), representing a mutation positive rate of at least 5% in this cohort (6/119). All 3 MLH1 mutation positive women had low grade histology while mutations in MSH2/6 were exclusively found in women with high risk histology. Two of the six mutation positive women were not identified by family history. Mutation positivity was higher in women under age 50 (23%; 5/22) compared to women > age 50 (1%; 1/97)( (p = 0.0008). LS-morphologic features were found in 58 (59%, n = 98) women. The sensitivity, specificity, PPV and NPV of the LS-associated features in predicting LS mutation status was 100%, 42.6%, 7.9% and 100% compared to IHC which was 100%, 76%, 18% and 100% and eFHQ which was 67%, 84%, 27%, 97%. Conclusions: In this unselected population of women with newly diagnosed EC the germline mutation rate for LS was 2-3 times that has previously been reported. Previously described LS-associated morphologic features were not specific to germline mutation status and family history missed one third of women with LS. IHC was the best strategy to identify women with EC who should undergo germline mutation testing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».