The C‐terminal domain of the Spt16 subunit of FACT affects transcription elongation
Notice bibliographique
Résumé
In the budding yeast S. cerevisiae , the abundant nuclear complex FACT ( F acilitates C hromatin T ransactions) is a heterodimer of two essential proteins: Spt16 and Pob3. FACT is highly conserved among eukaryotes, and has been implicated in transcription, DNA replication and DNA repair. To learn more about the roles FACT plays in these processes, genome‐wide synthetic‐lethal analysis of several mutant alleles of SPT16 was carried out. These mutant alleles were all identified by a dominant Spt ¯ phenotype, yet they yielded radically different patterns of genetic interactions. Those alleles that display interactions with genes involved in transcription elongation all contain mutations affecting the C‐terminal portion of Spt16; this clustering of mutations may identify a region of Spt16 responsible for the proposed histone‐chaperone activity of FACT. Further studies with one mutant allele that affects the C‐terminal domain, spt16‐E857K , demonstrate that this mutant protein interacts more weakly with histone H2B than does wild‐type Spt16 or a mutant Spt16 without C‐terminal‐domain alterations. We therefore propose a model in which weakened interactions between FACT and histones negatively affects transcription elongation. This work has been supported by the Natural Sciences and Engineering Research Council (NSERC) and the Canadian Institutes for Health Reseach (CIHR).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».