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Enregistrement W2663079491 · doi:10.1111/jcmm.13236

Expression of <scp>PTEN</scp>‐long mediated by <scp>CRISPR</scp>/Cas9 can repress U87 cell proliferation

2017· article· en· W2663079491 sur OpenAlexaff
Na Fang, Tingxuan Gu, Yahui Wang, Shuzhen Wang, Fengling Wang, Yang An, Wenqiang Wei, Weijuan Zhang, Xiangqian Guo, Adil J. Nazarali, Shaoping Ji

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular and Molecular Medicine · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Science Foundation of Henan ProvinceNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésPTENCRISPRBiologyCell growthPI3K/AKT/mTOR pathwayCellGeneCancer researchCell biologyMolecular biologyGeneticsSignal transduction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PTEN is a tumour suppressor that is frequently mutated in a variety of cancers. Hence, PTEN has significant potential as a therapeutic molecule. PTEN-long is an alternative translation variant, with an additional 173 amino acids added to the N-terminal of the canonical PTEN when CUG of the mRNA is utilized as the start codon. PTEN-long is secreted into serum and can re-enter cells throughout the body. One of the major barriers for gene therapy is to efficiently and specifically deliver DNA or RNA material to target cells. As an alternative approach, if a therapeutic protein can be directly delivered to target cell of interest, it should theoretically function well within the cells, particularly for genes that are deficiently expressed in vivo. Most therapeutic proteins are incapable of efficiently permeating the cell membrane. In this study, we have employed CRISPR/Cas9 gene editing tool combined with single-stranded template to edit CTG of PTEN-long to ATG in the genome. Two guide RNAs close to CTG site were found to have similar efficiency in driving PTEN-long expression. Furthermore, we detected PTEN-long expression in transfected whole-cell lysate and in concentrated culture media in Western blot. Interestingly, the culture media of PTEN-long expression can reduce Akt phosphorylation level and repress U87 cell proliferation compared to wild-type U87 or control media. Taken together, PTEN-long driven by CRISPR/Cas9 imports and exports cells and represses nearby cell proliferation, indicating the PTEN-long generated by CRISPR/Cas9 has potential to be an alternative strategy for PTEN gene therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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