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Enregistrement W2666391093 · doi:10.1038/s41598-017-03857-9

Network model predicts that CatSper is the main Ca2+ channel in the regulation of sea urchin sperm motility

2017· article· en· W2666391093 sur OpenAlexfundno aff
Jesús Espinal‐Enríquez, Daniel A. Priego-Espinosa, Alberto Darszon, Carmen Beltrán, Gustavo Martínez‐Mekler

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurobiology and Insect Physiology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDirección General de Asuntos del Personal Académico, Universidad Nacional Autónoma de MéxicoHospital for Sick ChildrenUniversidad Nacional Autónoma de MéxicoUniversità degli Studi di FirenzeConsejo Nacional de Ciencia y Tecnología
Mots-clésStrongylocentrotus purpuratusSea urchinBiologySpermChemotaxisCell biologyFlagellumAcrosome reactionCalcium signalingMotilityCalcium channelCalciumSignal transductionReceptorChemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Spermatozoa sea urchin swimming behaviour is regulated by small peptides from the egg outer envelope. Speract, such a peptide, after binding to its receptor inStrongylocentrotus purpuratussperm flagella, triggers a signaling pathway that culminates with a train of intracellular calcium oscillations, correlated with changes in sperm swimming pattern. This pathway has been widely studied but not fully characterized. Recent work onArbacia punctulatasea urchin spermatozoa has documented the presence of the Ca2+CatSper channel in their flagella and its involvement in chemotaxis. However, if other calcium channels participate in chemotaxis remains unclear. Here, based on an experimentally-backed logical network model, we conclude that CatSper is fundamental in theS. purpuratussperact-activated sea urchin sperm signaling cascade, although other Ca2+channels could still be relevant. We also present for the first time experimental corroboration of its active presence inS. purpuratussperm flagella. We argue, prompted byin silicoknock-out calculations, that CatSper is the main generator of calcium oscillations in the signaling pathway and that other calcium channels, if present, have a complementary role. The approach adopted here allows us to unveil processes, which are hard to detect exclusively by experimental procedures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,079
Tête enseignante GPT0,311
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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