PALB2 mutations in high-risk women with breast or ovarian cancer.
Notice bibliographique
Résumé
1527 Background: In Canada, genetic testing for BRCA1 and BRCA2 is available free of charge to women who meet eligibility criteria, based on personal and family history of cancer. Less than 10% of women are identified with a BRCA mutation, despite features of hereditary cancer. PALB2 has been identified as a moderate penetrance gene in various populations. In the current study, we examined the frequency of PALB2 mutations in women with breast or ovarian cancer who met criteria for genetic testing for BRCA1 and BRCA2and tested negative. Methods: DNA samples from women with breast or ovarian cancer, who met criteria for provincial BRCA1 and BRCA2 genetic testing and tested negative between the years of 2007 and 2014 were included in this study. All 13 coding exons of PALB2 plus 20 base pairs from the exon boundaries were amplified using Wafergen SmartChip technology. The amplified DNA were paired-end sequenced at 2x250 cycles using an Illumina MiSeq sequencer. Results: 2,225 women with breast cancer and 429 women with ovarian cancer were tested for PALB2 mutations. No PALB2 mutations were found in women with ovarian cancer. Seventeen deleterious PALB2 mutations were detected in women with breast cancer (0.8%). The frequency of PALB2 mutations was significantly higher in women with bilateral breast cancer (2.4%) compared to women with unilateral breast cancer (0.6%) (p = 0.01). There was no significant difference in age at diagnosis between those with and without a PALB2mutation (50.9 years vs 53.8 years; p = 0.34). Conclusions: Genetic testing for PALB2 should be considered for high-risk women with breast cancer, especially those who present with bilateral breast cancer. However, PALB2 does not appear to contribute to ovarian cancer which has implications for counselling women who are identified with a PALB2 mutation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».