<i>S100A10</i> identified in a genome-wide gene × cannabis dependence interaction analysis of risky sexual behaviours
Notice bibliographique
Résumé
Background: We conducted a genome-wide gene × environment interaction analysis to identify genetic variants that interact with cannabis dependence (CaD) in influencing risky sexual behaviours (RSB). Methods: Our sample included cannabis-exposed and sexually experienced African-American and European-American participants. A DSM-IV CaD diagnosis and RSB were evaluated using the Semi-Structured Assessment for Drug Dependence and Alcoholism. We analyzed RSBs as a score that takes into account experiences of unprotected sex and multiple sexual partners. Results: A total of 3350 people participated in our study; 43% had a CaD diagnosis, 56% were African-American and 33% were women. We identified a genome-wide significant locus in African-American participants ( S100A10 rs72993629, p = 2.73 × 10−8) and a potential transpopulation signal in women ( CLTC rs12944716, p = 5.27 × 10−8). A resting-state fMRI follow-up analysis of S100A10 rs72993629 conducted in an independent cohort showed 2 significant associations: reduced power of the left paracentral lobule in amplitude of low frequency fluctuations (ALFF) analysis ( p = 7.8 × 10−3) and reduced power of the right pallidum in fractional ALFF analysis ( p = 4.6 × 10−3). The activity of these brain regions is known to be involved in sexual functions and behaviours. The S100A10 result functionally recapitulated our S100B finding observed in our previous genome-wide association study of CaD. The probability of identifying 2 S100 genes in 2 independent genome-wide investigations by chance is approximately 1 in 1.1 million. Limitations: We were not able to identify any African-American cohort with appropriate sample size, and phenotypic assessment is available to replicate our findings. Conclusion: The S100A10 and S100B genes, which are located on different chromosomes, encode specialized calcium-binding proteins. These data support a role for calcium homeostasis in individuals with CaD and its induced behaviours.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,006 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».