MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2681884114 · doi:10.1101/301614

Computational assessment of arrhythmia potential in the heterogeneously perfused ventricle

2018· preprint· en· W2681884114 sur OpenAlexaff
Sanjay Kharche, Christopher W. McIntyre

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVentricleCardiologyElectrophysiologyPerfusionInternal medicineAction potentialIschemiaExtracellularMedicineDialysisChemistryAnesthesiaBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background The heterogeneity in the human left ventricle is augmented by heterogeneous perfusion defects in dialysis patients. We hypothesized that ischemic zones generated by heterogeneous perfusion are a cause of clinically observed post-dialysis arrhythmia. This preliminary study assessed the arrhythmia potential in a heterogeneously perfused 2D human ventricle computational model. Aim Our aim was to ascertain a relationship between the number of ischemia zones and incidence of multiple re-entrant waves in a 2D model of the human ventricle. Methods A human ventricle action potential model was modified to include the adenosine triphosphate (ATP) sensitive potassium current. Within ischemic zones, cell electrophysiological alterations due to ischemia were implemented as increased extracellular potassium, reduced intracellular ATP concentrations, as well as reduced upstroke current conductances. The cell model was incorporated into a spatial 2D model. The inter-cellular gap junction coupling was adjusted to simulate slow conduction in dialysis patient hearts. CT imaging data of the heart obtained during dialysis was analysed to estimate the approximate spatial size of ischemic zones. An ischemic border zone between the normal and central ischemic zones was implemented which had smoothly varying electrophysiological parameters. Arrhythmic potential was assessed using the paths of the centres of the re-entrant waves, called tip trajectories, and dominant frequency maps. Results Extracellular potassium elevated the resting potential and I KATP reduced the action potential’s duration. In the absence of ischemic zones, the propensity of the model to induce multiple re-entrant waves was low. The inclusion of ischemic zones provided the substrate for initiation of re-entrant wave fibrillation. The dominant frequency which measured the highest rate of pacing in the tissue increased drastically with the inclusion of ischemic zones, going from 3 Hz in the pre-dialysis state to over 6 Hz in the post-dialysis state. Re-entrant wave tip numbers increased from 1 tip in the pre-dialysis case to 34 in the post-dialysis case, a 34 fold increase. The increase of tip number was found to be strongly correlated to tissue heterogeneity in terms of ischemic zone numbers. Computational factors limiting a more extensive simulation of cause-effect combinations were identified. Conclusions A dialysis session restores systemic homeostasis, but promotes deleterious arrhythmias. Structure-function mechanistic modelling will permit patient-specific assessment of health status. Such an effort is expected to lead to application of wider physical sciences methods in the improvement of the lives of critically ill patients. High performance computing is a crucial requirement for such mechanistic assessment of health status.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetCardiac electrophysiology and arrhythmias→Travaux en français237 207→