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Enregistrement W2682847713 · doi:10.1002/humu.23282

Heterozygous variants in<i>ACTL6A</i>, encoding a component of the BAF complex, are associated with intellectual disability

2017· article· en· W2682847713 sur OpenAlexaff
Ronit Marom, Mahim Jain, Lindsay C. Burrage, I-Wen Song, Brett H. Graham, Chester Brown, Servi J.C. Stevens, Alexander P.A. Stegmann, Andrew T. Gunter, Julie Kaplan, Ralitza H. Gavrilova, Marwan Shinawi, Jill A. Rosenfeld, Yangjin Bae, Alyssa A. Tran, Yuqing Chen, James T. Lu, Richard A. Gibbs, Christine M. Eng, Yaping Yang, Justine Rousseau, Bert B.A. de Vries, Philippe M. Campeau, Brendan Lee

Notice bibliographique

RevueHuman Mutation · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChromatin Remodeling and Cancer
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteZonMwACMG Foundation for Genetic and Genomic MedicineNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesOsteogenesis Imperfecta Foundation
Mots-clésIntellectual disabilityBiologyMissense mutationGeneticsRNA splicingGeneMutationChromatin remodelingChromatin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathogenic variants in genes encoding components of the BRG1-associated factor (BAF) chromatin remodeling complex have been associated with intellectual disability syndromes. We identified heterozygous, novel variants in ACTL6A, a gene encoding a component of the BAF complex, in three subjects with varying degrees of intellectual disability. Two subjects have missense variants affecting highly conserved amino acid residues within the actin-like domain. Missense mutations in the homologous region in yeast actin were previously reported to be dominant lethal and were associated with impaired binding of the human ACTL6A to β-actin and BRG1. A third subject has a splicing variant that creates an in-frame deletion. Our findings suggest that the variants identified in our subjects may have a deleterious effect on the function of the protein by disturbing the integrity of the BAF complex. Thus, ACTL6A gene mutation analysis should be considered in patients with intellectual disability, learning disabilities, or developmental language disorder.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,820
Score d'incertitude au seuil0,224

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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