Taking Costs and Diagnostic Test Accuracy into Account When Designing Prevalence Studies: An Application to Childhood Tuberculosis Prevalence
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: When planning a study to estimate disease prevalence to a pre-specified precision, it is of interest to minimize total testing cost. This is particularly challenging in the absence of a perfect reference test for the disease because different combinations of imperfect tests need to be considered. We illustrate the problem and a solution by designing a study to estimate the prevalence of childhood tuberculosis in a hospital setting. METHODS: All possible combinations of 3 commonly used tuberculosis tests, including chest X-ray, tuberculin skin test, and a sputum-based test, either culture or Xpert, are considered. For each of the 11 possible test combinations, 3 Bayesian sample size criteria, including average coverage criterion, average length criterion and modified worst outcome criterion, are used to determine the required sample size and total testing cost, taking into consideration prior knowledge about the accuracy of the tests. RESULTS: In some cases, the required sample sizes and total testing costs were both reduced when more tests were used, whereas, in other examples, lower costs are achieved with fewer tests. CONCLUSION: Total testing cost should be formally considered when designing a prevalence study.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,095 | 0,367 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,003 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,004 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».