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Enregistrement W2717012218 · doi:10.1094/phyto-02-17-0049-r

<i>Tobacco rattle virus</i> (TRV)-Mediated Silencing of <i>Nicotiana benthamiana ARGONAUTES</i> (<i>NbAGOs</i>) Reveals New Antiviral Candidates and Dominant Effects of TRV-<i>NbAGO1</i>

2017· article· en· W2717012218 sur OpenAlexaff
Denis Odokonyero, Maria R. Mendoza, Peter Moffett, Karen‐Beth G. Scholthof

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and AgricultureTexas AgriLife ResearchU.S. Department of Agriculture
Mots-clésTobacco rattle virusNicotiana benthamianaBiologyGene silencingVirologyPotexvirusVirusTobacco mosaic virusPlant virusGeneticsGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this study was to determine the contribution of different ARGONAUTE proteins in Nicotiana benthamiana (NbAGOs) to the defense against silencing sensitive GFP-expressing viral constructs based on Tomato bushy stunt virus (TBSV) (Tombusvirus), Sunn-hemp mosaic virus (Tobamovirus), and Foxtail mosaic virus (Potexvirus). Upon Tobacco rattle virus (TRV)-mediated down-regulation of NbAGO1, 4, 5, or 6, no effects were noted on susceptibility to any virus construct, whereas knockdown of NbAGO2 specifically prevented silencing of P19-defective TBSV (TGdP19). Down-regulation of a new gene referred to as NbAGO5L showed some reduced silencing for TGdP19 but not for the other two virus constructs, whereas silencing of NbAGO7 gave rise to a subtle increase in susceptibility to all three viruses. Co-infiltrating different TRV-NbAGO constructs simultaneously did not enhance virus susceptibility. However, an unexpected finding was that whenever the TRV-NbAGO1 construct was present, this compromised silencing of genes targeted by co-infiltrated constructs, as shown upon co-infiltration of TRV-NbAGO1 with either TRV-NbAGO2 or TRV-Sul (targeting Magnesium chelatase I). Only after a prolonged period (approximately 2 months) did TRV-Sul-mediated systemic bleaching occur in these co-infected plants, suggesting that TRV-NbAGO1 hinders the silencing ability of other TRV-NbAGO constructs. In conclusion, this study revealed new antiviral NbAGOs and dominant effects of silencing NbAGO1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,231
Score d'incertitude au seuil0,668

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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