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Enregistrement W2724373555 · doi:10.1021/acsnano.7b03004

Spatially Selective Dissection of Signal Transduction in Neurons Grown on Netrin-1 Printed Nanoarrays <i>via</i> Segmented Fluorescence Fluctuation Analysis

2017· article· en· W2724373555 sur OpenAlexafffund
Angelica A. Gopal, Sébastien G. Ricoult, Stephanie N. Harris, David Juncker, Timothy E. Kennedy, Paul W. Wiseman

Notice bibliographique

RevueACS Nano · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésNetrinDeleted in Colorectal CancerNanodotTotal internal reflection fluorescence microscopeGrowth coneBiophysicsActin cytoskeletonActinMaterials scienceAxon guidanceCell biologyCytoskeletonAxonBiologyNanotechnologyMembraneBiochemistryCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Axonal growth cones extend during neural development in response to precise distributions of extracellular cues. Deleted in colorectal cancer (DCC), a receptor for the chemotropic guidance cue netrin-1, directs F-actin reorganization, and is essential for mammalian neural development. To elucidate how the extracellular distribution of netrin-1 influences the distribution of DCC and F-actin within axonal growth cones, we patterned nanoarrays of substrate bound netrin-1 using lift-off nanocontact printing. The distribution of DCC and F-actin in embryonic rat cortical neuron growth cones was then imaged using total internal reflection fluorescence (TIRF) microscopy. Fluorescence fluctuation analysis via image cross-correlation spectroscopy (ICCS) was applied to extract the molecular density and aggregation state of DCC and F-actin, identifying the fraction of DCC and F-actin colocalizing with the patterned netrin-1 substrate. ICCS measurement of spatially segmented images based on the substrate nanodot patterns revealed distinct molecular distributions of F-actin and DCC in regions directly overlying the nanodots compared to over the reference surface surrounding the nanodots. Quantifiable variations between the populations of DCC and F-actin on and off the nanodots reveal specific responses to the printed protein substrate. We report that nanodots of substrate-bound netrin-1 locally recruit and aggregate DCC and direct F-actin organization. These effects were blocked by tetanus toxin, consistent with netrin-1 locally recruiting DCC to the plasma membrane via a VAMP2-dependent mechanism. Our findings demonstrate the utility of segmented ICCS image analysis, combined with precisely patterned immobilized ligands, to reveal local receptor distribution and signaling within specialized subcellular compartments.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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