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Enregistrement W2725141796 · doi:10.1021/acs.jproteome.7b00046

Proteomic Analysis of the E3 Ubiquitin-Ligase Hakai Highlights a Role in Plasticity of the Cytoskeleton Dynamics and in the Proteasome System

2017· article· en· W2725141796 sur OpenAlexfundno aff
Andrea Díaz-Díaz, Alba Casas-Pais, V. Calamia, Raquel Castosa, Olaia Martínez-Iglesias, Daniel Roca‐Lema, Isabel Santamarina, Manuel Valladares‐Ayerbes, Lourdes Calvo, V. Chantada, Angélica Figueroa

Notice bibliographique

RevueJournal of Proteome Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIEuropean Regional Development FundHakai InstituteConsellería de Cultura, Educación e Ordenación Universitaria, Xunta de GaliciaMinisterio de Educación, Cultura y Deporte
Mots-clésUbiquitinUbiquitin ligaseProteasomeBiologyCell biologyEpithelial–mesenchymal transitionCadherinCancer cellCancer researchCancerCellBiochemistryMetastasisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Carcinoma, the most common type of cancer, arises from epithelial cells. The transition from adenoma to carcinoma is associated with the loss of E-cadherin and, in consequence, the disruption of cell-cell contacts. E-cadherin is a tumor suppressor, and it is down-regulated during epithelial-to-mesenchymal transition (EMT); indeed, its loss is a predictor of poor prognosis. Hakai is an E3 ubiquitin-ligase protein that mediates E-cadherin ubiquitination, endocytosis and finally degradation, leading the alterations of cell-cell contacts. Although E-cadherin is the most established substrate for Hakai activity, other regulated molecular targets for Hakai may be involved in cancer cell plasticity during tumor progression. In this work we employed an iTRAQ approach to explore novel molecular pathways involved in Hakai-driven EMT during tumor progression. Our results show that Hakai may have an important influence on cytoskeleton-related proteins, extracellular exosome-associated proteins, RNA-related proteins and proteins involved in metabolism. Moreover, a profound decreased expression in several proteasome subunits during Hakai-driven EMT was highlighted. Since proteasome inhibitors are becoming increasingly used in cancer treatment, our findings suggest that the E3 ubiquitin-ligase, such as Hakai, may be a better target than proteasome for using novel specific inhibitors in tumor subtypes that follow EMT.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,199
Score d'incertitude au seuil0,328

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,314
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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