The structure of <i>Plasmodium falciparum</i> 3D7_0606800 reveals a bi‐lobed architecture that supports re‐annotation as a Venus Flytrap protein
Notice bibliographique
Résumé
Plasmodium falciparum, the causative agent of malaria, employs a diverse array of surface displayed proteins to promote dissemination and establish infection in the human host. Of these, Pf3D7_0606800 is highly immunogenic and has been designated a potential top 10 candidate for inclusion in a multicomponent malarial vaccine. The role of Pf3D7_0606800 in parasite biology, however, is unknown and its characterization has been complicated by a lack of sequence identity with proteins of known structure or function. Towards elucidating Pf3D7_0606800 function, we determined its structure to a resolution of 2.35 Å using selenium single wavelength anomalous dispersion. A bi-lobed architecture displays the core structural hallmarks of Venus Flytrap (VFT) proteins prompting us to re-annotate Pf3D7_0606800 as PfVFT1. Structural analysis further revealed an extended inter-lobe groove that, when interrogated by molecular docking, appears well suited to bind peptide-based ligands. Collectively, our structural characterization of the highly antigenic P. falciparum surface protein PfVFT1 provides intriguing functional insight and establishes a structural template that could prove valuable for malaria vaccine engineering studies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».