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Enregistrement W2725864050 · doi:10.1371/journal.pone.0179326

Metabolomic profiling to characterize acute intestinal ischemia/reperfusion injury

2017· article· en· W2725864050 sur OpenAlexafffund
Rachel G. Khadaroo, Thomas A. Churchill, Victor Tso, Karen Madsen, Chris M. Lukowski, Saad Y. Salim

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesEdmonton Civic Employees Charitable Assistance Fund
Mots-clésMedicineIschemiaCreatinineSepsisMetaboliteAllantoinUrinary systemSuperior mesenteric arteryInternal medicineAcute kidney injuryGastroenterologyPathologyBiologyBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sepsis and septic shock are the leading causes of death in critically ill patients. Acute intestinal ischemia/reperfusion (AII/R) is an adaptive response to shock. The high mortality rate from AII/R is due to the severity of the disease and, more importantly, the failure of timely diagnosis. The objective of this investigation is to use nuclear magnetic resonance (NMR) analysis to characterize urine metabolomic profile of AII/R injury in a mouse model. Animals were exposed to sham, early (30 min) or late (60 min) acute intestinal ischemia by complete occlusion of the superior mesenteric artery, followed by 2 hrs of reperfusion. Urine was collected and analyzed by NMR spectroscopy. Urinary metabolite concentrations demonstrated that different profiles could be delineated based on the duration of the intestinal ischemia. Metabolites such as allantoin, creatinine, proline, and methylamine could be predictive of AII/R injury. Lactate, currently used for clinical diagnosis, was found not to significantly contribute to the classification model for either early or late ischemia. This study demonstrates that patterns of changes in urinary metabolites are effective at distinguishing AII/R progression in an animal model. This is a proof-of-concept study to further support examination of metabolites in the clinical diagnosis of intestinal ischemia reperfusion injury in patients. The discovery of a fingerprint metabolite profile of AII/R will be a major advancement in the diagnosis, treatment, and prevention of systemic injury in critically ill patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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