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Enregistrement W2727112076 · doi:10.1200/jco.2017.35.15_suppl.e21060

Non-classical BRAF melanoma: A retrospective review of disease characteristics and prognostic implications.

2017· review· en· W2727112076 sur OpenAlexaff
Ambika Parmar, Harriet Feilotter, Tara Baetz

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2017
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMelanoma and MAPK Pathways
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineV600EMelanomaRetrospective cohort studyInternal medicineOncologyCohortCancerDiseaseMutationVemurafenibCancer researchMetastatic melanomaGeneGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e21060 Background: Activating mutations in the BRAF gene occur in 40-60% of melanomas with the majority of mutations resulting in V600E/K. Previous cohort studies have identified rates of non-V600E/K BRAF mutations to occur in 5-12% of patients. Despite this, there remains limited evidence characterizing the disease characteristics and outcomes of patients who harbor the non-classical BRAF mutation. Methods: Retrospective review of all melanoma patients treated at a tertiary cancer center that had BRAF mutation testing through targeted sequencing. Three groups of patients were identified and compared with respect to patient and disease characteristics: a) BRAF negative; b) BRAF V600E/K positive; c) BRAF non-V600E/K positive. Results: BRAF testing was performed in 168 melanoma patients of which 101 (60%) were BRAF negative; 55 (33%) were BRAF V600E/K positive; 12 (7%) were BRAF non-V600E/K positive (2 G466E, 1 of each G469E, K601N, K601E, L597Q, L597S, V741I, N594G, D594N, V600R and 1 with both K601N & V600E). Of these, 147 patients had baseline demographic and treatment data available for analysis. BRAF mutations were more common among males (45.6% of men vs. 22.7% of women, p = 0.03). No significant differences between other baseline patient demographics noted. Pathological characteristics revealed a non-significant trend toward poorer prognostic factors with BRAF non-V600E/K patients having increased Breslow depth (7.0 mm vs. 5.0 mm BRAF negative, 4.3 mm BRAF V600E/K) and higher rates of ulceration (71% vs. 44% BRAF negative, 30% BRAF V600E/K). BRAF non-V600E/K patients displayed a non-significant trend toward poorer overall survival (71 months vs. 215 months BRAF negative, 125 months BRAF V600E/K). Conclusions: Non-V600E/K BRAF positive patients appear to display less favorable disease characteristics and outcomes as compared to BRAF negative and BRAF V600E/K positive patients. Non-V600E/K melanoma show limited response to BRAF targeted therapy; however, evidence suggests the presence of non-classical mutations may confer susceptibility to MEK inhibition. Further characterization of non-V600E/K BRAF melanoma may allow for more refined prognostication and treatment decisions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,146
Tête enseignante GPT0,476
Écart entre enseignants0,330 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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