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Enregistrement W2728222667 · doi:10.1002/iub.1649

Gene cloning, characterization, and cytotoxic activity of methionine γ‐lyase from <i>Clostridium novyi</i>

2017· article· en· W2728222667 sur OpenAlexfundno aff
Vitalia V. Kulikova, Elena A. Morozova, Svetlana V. Revtovich, Mikhail I. Kotlov, Natalya V. Anufrieva, N. P. Bazhulina, Samanta Raboni, Serena Faggiano, Edi Gabellieri, Patrizia Cioni, Yury Belyi, Andrea Mozzarelli, Tatyana V. Demidkina

Notice bibliographique

RevueIUBMB Life · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Research and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRussian Foundation for Basic ResearchCanadian Institute of Mining, Metallurgy and Petroleum
Mots-clésChemistryCitrobacter freundiiBiochemistryCysteineMethionineEnzymeCytotoxicityIodoacetamideMolecular biologyIn vitroBiologyKlebsiella pneumoniaeEscherichia coliAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The exploitation of methionine‐depleting enzyme methionine γ‐lyase (MGL) is a promising strategy against specific cancer cells that are strongly dependent on methionine. To identify MGL from different sources with high catalytic activity and efficient anticancer action, we have expressed and characterized MGL from Clostridium novyi and compared its catalytic efficiency with the previously studied MGL from Citrobacter freundii . The purified recombinant MGL exhibits k cat and k cat /K m for methionine γ‐elimination reaction that are 2.4‐ and 1.36‐fold higher than C. freundii enzyme, respectively, whereas absorption, fluorescence, and circular dichroism spectra are very similar, as expected on the basis of 87% sequence identity and high conservation of active site residues. The reactivity of cysteine residues with DTNB and iodoacetamide was investigated as well as the impact of their chemical modification on catalytic activity. This information is relevant because for increasing bioavailability and reducing immunogenity, MGL should be decorated with polyethylene glycol (PEG). It was found that Cys118 is a faster reacting residue, which results in a significant decrease in the γ‐elimination activity. Thus, the protection of Cys118 before conjugation with cysteine‐reacting PEG represents a valuable strategy to preserve MGL activity. The anticancer action of C. novyi MGL, evaluated in vitro against prostate (PC‐3), chronic myelogenous leucemia (K562), and breast (MDA‐MB‐231 and MCF7) cancer cells, exhibits IC 50 of 1.3 U mL −1 , 4.4 U mL −1 , 1.2 U mL −1 , and 3.4 U mL −1 , respectively. A higher cytotoxicity of C. novyi MGL was found against cancer cells with respect to C. freundii MGL, with the exception of PC‐3, where a lower cytotoxicity was observed. © 2017 IUBMB Life, 69(9):668–676, 2017

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,100
Score d'incertitude au seuil0,395

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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