Features of lineage‐specific hematopoietic metabolism revealed by mitochondrial proteomics
Notice bibliographique
Résumé
Hematopoietic bone marrow is a regenerative tissue of high clinical relevance, yet relatively little is known about the metabolism of the stem and progenitor populations concerned. We have used a multipotent murine cell line to generate sufficient numbers of cells undergoing self-renewal, erythroid or myeloid differentiation to allow a proteomics analysis of enriched mitochondria. Stringent analysis identified 37 mitochondria-associated proteins changing on differentiation in this system. Those induced during differentiation were commonly associated with mature cell functions, while those inactivated upon differentiation indicate widespread changes in mitochondrial transport, fatty acid catabolism and oxidative phosphorylation. An erythroid specific reduction in glutamate pyruvate amino transferase 2 was confirmed at the protein level by Western blotting and at the functional level by assays of metabolite turnover. In addition to validating the dataset, these findings suggest significant differences in the core-metabolism between erythropoiesis and myelopoiesis. This knowledge is of relevance to the in vitro production of cell therapy products and to studies of the interdependence of metabolic and signaling pathways in regenerative tissues. Data are available via ProteomeXchange with identifier PXD002968.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».