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Enregistrement W2728862018 · doi:10.3343/alm.2017.37.5.408

Comparison of the Luminex xTAG Respiratory Viral Panel Fast v2 Assay With Anyplex II RV16 Detection Kit and AdvanSure RV Real-Time RT-PCR Assay for the Detection of Respiratory Viruses

2017· article· en· W2728862018 sur OpenAlexaboutno aff
Dae‐Hyun Ko, Hyun Soo Kim, Jungwon Hyun, Han-Sung Kim, Jae‐Seok Kim, Kyoung Un Park, Wonkeun Song

Notice bibliographique

RevueAnnals of Laboratory Medicine · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésReal-time polymerase chain reactionVirologyRespiratory systemBiologyMedicineInternal medicineGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The accurate and rapid identification of the causative viruses is important for the timely diagnosis and management of respiratory infections. Multiplex molecular diagnostic techniques have been widely adopted to detect respiratory viruses. We compared the results of a newly upgraded, multiplex, molecular bead-based respiratory viral panel (RVP) assay with the results of Anyplex II RV16 detection kit and AdvanSure RV real-time RT-PCR assay. METHODS: We tested 254 respiratory specimens and cultured viral strains using the Luminex xTAG RVP Fast v2 assay (Luminex Molecular Diagnostics, Canada) and Anyplex II RV16 detection kit and compared the results. Specimens showing discordant results between the two assays were tested with a AdvanSure RV real-time RT-PCR assay. RESULTS: Of the 254 respiratory specimens, there was total agreement in the results between the xTAG RVP Fast v2 assay and the other real-time PCR assay in 94.1-100% of the specimens. The agreement levels were relatively low (94.1-97.6%) for specimens of adenovirus, coronavirus NL63, and parainfluenza type 3. In comparison to the other assay, the xTAG RVP Fast v2 assay detected a higher number of parainfluenza type 3 (4 cases) and metapneumovirus (9 cases). CONCLUSIONS: The xTAG RVP Fast v2 assay showed comparable capabilities compared with the other assays; it will be useful for identifying respiratory viral infections in patients with respiratory symptoms. Clinicians should be aware of the characteristics of the assays they use, since different assays show different detectability for each virus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Études des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,182
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,164
Tête enseignante GPT0,431
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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