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Enregistrement W2728898287 · doi:10.1093/jme/tjx036

A Risk Model for the Lyme Disease Vector Ixodes scapularis (Acari: Ixodidae) in the Prairie Provinces of Canada

2017· article· en· W2728898287 sur OpenAlexafffundabout
Vanessa Gabriele-Rivet, Jules K. Koffi, Yann Pelcat, Julie Arsenault, Angela Cheng, L. Robbin Lindsay, Tim Lysyk, Kateryn Rochon, Nicholas H. Ogden

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Entomology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaEnvironment and Climate Change CanadaUniversity of ManitobaPublic Health Agency of CanadaUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Resources CanadaPublic Health Agency
Mots-clésIxodes scapularisLyme diseaseBiologyIxodidaeParasitiformesVeterinary medicineAcariEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lyme disease is emerging in Canada due to geographic range expansion of the tick vector Ixodes scapularis Say. Recent areas of emergence include parts of the southeastern Canadian Prairie region. We developed a map of potential risk areas for future I. scapularis establishment in the Canadian Prairie Provinces. Six I. scapularis risk algorithms were developed using different formulations of three indices for environmental suitability: temperature using annual cumulative degree-days > 0 °C (DD > 0 °C; obtained from Moderate Resolution Imaging Spectroradiometer satellite data as an index of conditions that allow I. scapularis to complete its life cycle), habitat as a combined geolayer of forest cover and agricultural land use, and rainfall. The relative performance of these risk algorithms was assessed using receiver-operating characteristic (ROC) area under the curve (AUC) analysis with data on presence-absence of I. scapularis obtained from recent field surveillance in the Prairie Provinces accumulated from a number of sources. The ROC AUC values for the risk algorithms were significantly different (P < 0.01). The algorithm with six categories of DD > 0 °C, habitat as a simple dichotomous variable of presence or absence of forest, and normalized rainfall had the highest AUC of 0.74, representing "fair to good" performance of the risk algorithm. This algorithm had good (>80%) sensitivity in predicting positive I. scapularis surveillance sites, but low (50%) specificity as expected in this region where not all environmentally suitable habitats are expected to be occupied. Further prospective studies are needed to validate and perhaps improve the risk algorithm.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,183
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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