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Enregistrement W2729574155 · doi:10.1002/jcb.26250

N‐linked glycosylation of <i>a</i> subunit isoforms is critical for vertebrate vacuolar H<sup>+</sup>‐ATPase (V‐ATPase) biosynthesis

2017· article· en· W2729574155 sur OpenAlexafffund
Sally Esmail, Norbert Kartner, Yeqi Yao, Joo Wan Kim, Reinhart A.F. Reithmeier, Morris F. Manolson

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueATP Synthase and ATPases Research
Établissements canadiensToronto Rehabilitation InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésGlycosylationGene isoformProtein subunitImmunoprecipitationBiologyN-linked glycosylationHEK 293 cellsMolecular biologyBiochemistryCell biologyGlycoproteinGeneGlycan

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

membrane-integrated sector of human V-ATPase has four isoforms, a1-a4, with diverse and crucial functions in health and disease. They are encoded by four conserved paralogous genes, and their vertebrate orthologs have positionally conserved N-glycosylation sequons within the second extracellular loop, EL2, of the a subunit membrane domain. Previously, we have shown directly that the predicted sequon for the a4 isoform is indeed N-glycosylated. Here we extend our investigation to the other isoforms by transiently transfecting HEK 293 cells to express cDNA constructs of epitope-tagged human a1-a3 subunits, with or without mutations that convert Asn to Gln at putative N-glycosylation sites. Expression and N-glycosylation were characterized by immunoblotting and mobility shifts after enzymatic deglycosylation, and intracellular localization was determined using immunofluorescence microscopy. All unglycosylated mutants, where predicted N-glycosylation sites had been eliminated by sequon mutagenesis, showed increased relative mobility on immunoblots, identical to what was seen for wild-type a subunits after enzymatic deglycosylation. Cycloheximide-chase experiments showed that unglycosylated subunits were turned over at a higher rate than N-glycosylated forms by degradation in the proteasomal pathway. Immunofluorescence colocalization analysis showed that unglycosylated a subunits were retained in the ER, and co-immunoprecipitation studies showed that they were unable to associate with the V-ATPase assembly chaperone, VMA21. Taken together with our previous a4 subunit studies, these observations show that N-glycosylation is crucial in all four human V-ATPase a subunit isoforms for protein stability and ultimately for functional incorporation into V-ATPase complexes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,289 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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