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Enregistrement W2730038733 · doi:10.1177/0962280217713347

Causality on longitudinal data: Stable specification search in constrained structural equation modeling

2017· article· en· W2730038733 sur OpenAlexfundno aff
Ridho Rahmadi, Marieke HC van Rijn, Jan AJG van den Brand, M. Heins, Hans Knoop, Tom Heskes

Notice bibliographique

RevueStatistical Methods in Medical Research · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueAdvanced Causal Inference Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthIXICOH. Lundbeck A/SEisaiServierUniversity of California, San DiegoUniversity of GlasgowRadboud UniversiteitUniversity of AberdeenNewcastle UniversityNorthern California Institute for Research and EducationGenentechUniversity of DundeeBioClinicaBiogenPfizerNovartis Pharmaceuticals CorporationUniversity of Southern CaliforniaU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbMeso Scale DiagnosticsLeids Universitair Medisch CentrumUniversiteit LeidenAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeAlzheimer's Association
Mots-clésComputer scienceCausal modelCausality (physics)Stability (learning theory)Structural equation modelingSet (abstract data type)Machine learningArtificial intelligenceData miningMathematicsStatistics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A typical problem in causal modeling is the instability of model structure learning, i.e., small changes in finite data can result in completely different optimal models. The present work introduces a novel causal modeling algorithm for longitudinal data, that is robust for finite samples based on recent advances in stability selection using subsampling and selection algorithms. Our approach uses exploratory search but allows incorporation of prior knowledge, e.g., the absence of a particular causal relationship between two specific variables. We represent causal relationships using structural equation models. Models are scored along two objectives: the model fit and the model complexity. Since both objectives are often conflicting, we apply a multi-objective evolutionary algorithm to search for Pareto optimal models. To handle the instability of small finite data samples, we repeatedly subsample the data and select those substructures (from the optimal models) that are both stable and parsimonious. These substructures can be visualized through a causal graph. Our more exploratory approach achieves at least comparable performance as, but often a significant improvement over state-of-the-art alternative approaches on a simulated data set with a known ground truth. We also present the results of our method on three real-world longitudinal data sets on chronic fatigue syndrome, Alzheimer disease, and chronic kidney disease. The findings obtained with our approach are generally in line with results from more hypothesis-driven analyses in earlier studies and suggest some novel relationships that deserve further research.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,037
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,198
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,483
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0370,198
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0000,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,872
Tête enseignante GPT0,725
Écart entre enseignants0,147 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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