MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2730057370 · doi:10.1371/journal.pone.0180586

A hypoxia response element in the Vegfa promoter is required for basal Vegfa expression in skin and for optimal granulation tissue formation during wound healing in mice

2017· article· en· W2730057370 sur OpenAlexafffund
Domenic Ciarlillo, Christophe Céleste, Peter Carmeliet, Derek Boerboom, Christine L. Theoret

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésVascular endothelial growth factor APDGFBGranulation tissueWound healingAngiogenesisBiologyVascular endothelial growth factorMolecular biologyCancer researchImmunologyGrowth factorPlatelet-derived growth factor receptorGeneticsVEGF receptorsReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypoxia in skin wounds is thought to contribute to healing through the induction of hypoxia inducible factor-1 (HIF-1). Although HIF-1 can regulate the expression of vascular endothelial growth factor A (Vegfa), whether hypoxia and HIF-1 are required to induce Vegfa expression in the context of wound healing is unknown. To test this hypothesis, we evaluated Vegfa expression and wound healing in mutant mice that lack a functional HIF-1 binding site in the Vegfa promoter. Full-thickness excisional wounds were made using a biopsy punch, left to heal by second intention, and granulation tissue isolated on a time course during healing. mRNA levels of Vegfa and its target genes platelet-derived growth factors B (Pdgfb) and stromal cell-derived factor-1 (Sdf1) were measured by RT-qPCR, and HIF-1alpha and VEGFA protein levels measured by immunoblotting. Lower levels of Vegfa, Pdgf1 and Sdf1 mRNA were found in intact skin of mutant mice relative to wild-type controls (n = 6 mice/genotype), whereas levels in granulation tissue during wound healing were unaltered. VEGFA protein levels were also lower in intact skin of the mutant versus the wild-type mice. Decreased Vegfa mRNA levels in skin of mutant mice could not be attributed to decreased HIF-1alpha protein expression, and were therefore a consequence of the loss of HIF-1 responsiveness of the Vegfa promoter. Comparative histologic analyses of healing wounds in mutant and wild-type mice (n = 8 mice/genotype) revealed significant defects in granulation tissue in the mutant mice, both in terms of quantity and capillary density, although epithelialization and healing rates were unaltered. We conclude that HIF-1 is not a major regulator of Vegfa expression during wound healing; rather, it serves to maintain basal levels of expression of Vegfa and its target genes in intact skin, which are required for optimal granulation tissue formation in response to wounding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2017
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetCancer, Hypoxia, and MetabolismTravaux en français237 207