Abstract 232: A Genome-wide Association of Murine Echocardiographic Measures Implicates Muscle A-type Lamin-interacting Protein (MLIP) in Isoproterenol-induced Interventricular Septal Hypertrophy
Notice bibliographique
Résumé
Genome-wide association studies of heart failure in humans have yielded limited results, largely due to highly heterogeneous environmental and genetic backgrounds. The Hybrid Mouse Diversity Panel consists of inbred strains that are either fully sequenced or densely genotyped and as a whole displays significant natural variations. We assessed the hypothesis that precise environmental control, a well-defined genetic background, and a careful and uniform phenotyping scheme enable high-resolution mapping of cardiac remodeling in an isoproterenol-induced heart failure mouse model. Eight to ten-week old females from 105 inbred mouse strains (average N per strain = 6.7) were divided into control (average N per strain = 2.5) and treated (average N per strain =4.1) cohorts. Treated mice received 20 μg/g/day of isoproterenol through an abdominally implanted Alzet micropump for 3 weeks. All mice underwent echocardiography at baseline and at weekly time points. Phenotypic data were analyzed using the Efficient Mixed-Model Association (EMMA) algorithm to correct for population substructure. Our study showed that chronic isoproterenol administration resulted in marked inter-strain variations in echocardiographic measurements across the mouse panel. EMMA analysis of the data revealed many significant association peaks across echocardiographic measures. The most significant association signal is in the change of diastolic interventricular septal wall thickness between baseline and 1 week after isoproterenol treatment, a marker of early isoproterenol-induced left ventricular hypertrophy. The peak SNP rs13480288 (p-value of 4.0580e-09) and its surrounding SNPs (within correlation r2 > 0.8) span across 3 genes. Of these, Mlip alone harbors a missence variant and a splice-site variant across our panel. Mlip, also known as muscle A-type lamin-interacting protein, is expressed abundantly in the heart and interacts directly with A-type lamins in the nuclear envelope. Mutations in A-type lamins have been shown to cause both hypertrophic and dilated cardiomyopathy. In conclusion, our study results provide strong evidence that genetic variations in Mlip contribute to differential responses in interverntricular septal hypertrophy to isoproterenol.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».