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Enregistrement W2731395709 · doi:10.1101/160440

Toward leveraging big data in human functional connectomics: Generalization of brain graphs across scanners, sessions, and paradigms

2017· preprint· en· W2731395709 sur OpenAlexaff
Hengyi Cao, Sarah McEwen, Carrie E. Bearden, Jean Addington, Bradley G. Goodyear, Kristin S. Cadenhead, Heline Mirzakhanian, Barbara A. Cornblatt, Doreen M. Olvet, Daniel H. Mathalon, Thomas H. McGlashan, Diana O. Perkins, Ayşenil Belger, Larry J. Seidman, Heidi W. Thermenos, Ming T. Tsuang, Theo G.M. van Erp, Elaine F. Walker, Stephan Hamann, Scott W. Woods, Tyrone D. Cannon

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueFunctional Brain Connectivity Studies
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneralizability theoryComputer scienceReliability (semiconductor)ConnectomicsContext (archaeology)CognitionFunctional connectivityTask (project management)GeneralizationSample size determinationAttention networkArtificial intelligenceConnectomeMachine learningPsychologyNeurosciencePower (physics)Mathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract While graph theoretical modeling has dramatically advanced our understanding of complex brain systems, the feasibility of aggregating brain graphic data in large imaging consortia remains unclear. Here, using a battery of cognitive, emotional and resting fMRI paradigms, we investigated the reproducibility of functional connectomic measures across multiple sites and sessions. Our results revealed overall fair to excellent reliability for a majority of measures during both rest and tasks, in particular for those quantifying connectivity strength, network segregation and network integration. Higher reliabilities were detected for cognitive tasks (vs rest) and for weighted networks (vs binary networks). While network diagnostics for several primary functional systems were consistently reliable independently of paradigm, those for cognitive-emotional systems were reliable predominantly when challenged by task. Different data aggregation approaches yielded significantly different reliability. In addition, we showed that after accounting for observed reliability, satisfactory statistical power can be achieved in the multisite context with a total sample size of approximately 250 when the effect size is at least moderate. Our findings provide direct evidence for the generalizability of brain graphs for both resting and task paradigms in large consortia and encourage the use of multisite, multisession scans to enhance power for human functional connectomic studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,051
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,148
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,051
Score d'incertitude au seuil0,269

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0510,148
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0010,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,115
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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