A Simple Gold Nanoprobe Assay for the Identification of Staphylococcus Aureus, Listeria Monocytogenes and Salmonella Enteritidis in Food Specimens
Notice bibliographique
Résumé
In the present study, we developed a gold nanoprobe assay, which relies on the colorimetric differentiation of specific DNA sequences, based on different aggregation profiles. We evaluated the assay on DNA extracted from pathogen cultures and from contaminated food specimens. The targets used were the femA gene for the identification of Staphylococcus aureus, the hly gene of the Listeria monocytogenes listeriolysin and the invA sequence for Salmonella spp. Comparison was performed with the reference assay, as described in the respective ISO guidelines for each pathogen, and a direct PCR amplification and detection. The minimum detection limit of the assay was defined at 123 fg/μL DNA, for all species, lower than PCR detection. Specificity was 100%. Sensitivity was 100%, as compared το the reference method, whereas the sensitivity of PCR was 93.3%. The evaluated assay could be used as a sensitive screening method, which does not require major infrastructure, for the detection and identification of pathogens in food specimens. In addition, it can accommodate detection of multiplespecies,thus allowing multiplexingand expedite turnaround time.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».