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Enregistrement W2732519908 · doi:10.1101/158642

Type 2 Diabetes Risk Alleles Reveal a Role for Peptidylglycine Alpha-amidating Monooxygenase in Beta Cell Function

2017· preprint· en· W2732519908 sur OpenAlexaff
Anne Raimondo, Soren K. Thomsen, Benoît Hastoy, Mahesh M. Umapathysivam, Xiao-Qing Dai, Jocelyn E. Manning Fox, Amy Barrett, Christopher J. Groves, Austin Bautista, Nicola L. Beer, Anne Clark, Patrick E. MacDonald, Patrik Rorsman, Anna L. Gloyn

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2017
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésAlleleExocytosisBiologyCell biologyGeneticsSecretionGeneEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Molecular mechanisms underpinning the genetic risk for type 2 diabetes (T2D) remain poorly understood, hindering translation into new therapies. Recently, genome-wide studies identified two coding variants in Peptidylglycine Alpha-amidating Monooxygenase ( PAM ) associated with T2D risk and measures of beta cell dysfunction. Here, we demonstrate that both risk alleles impact negatively on overall PAM activity, but via distinct effects on expression and catalytic function. In a human beta cell model, PAM silencing caused decreased insulin content and altered dynamics of granule exocytosis. Analysis of primary human beta cells from cadaveric donors confirmed an effect on exocytosis in carriers of the p.D563G T2D-risk allele. Finally, we show that the granular packaging protein Chromogranin A is a PAM substrate and a strong candidate for mediating downstream effects on insulin secretion. Taken together, our results establish a role for PAM in beta cell function, and uncover a novel mechanism for T2D-associated PAM alleles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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