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Enregistrement W2733549173 · doi:10.1161/res.111.suppl_1.a224

Abstract 224: Crosstalk Between Mitochondrial and ER Death Pathways in the Heart

2012· article· en· W2733549173 sur OpenAlexaff
Agnieszka Biala, Yan Wang, Rimpy Dhingra, Hongying Gang, Lorrie A. Kirshenbaum

Notice bibliographique

RevueCirculation Research · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagyCell biologyBiologyCrosstalkRNA splicingMitochondrionExonEndoplasmic reticulumAlternative splicingProgrammed cell deathGene isoformUnfolded protein responseATG16L1ApoptosisGeneGeneticsRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alternative gene splicing provides a versatile mechanism by which cells generate proteins with different or even antagonistic properties. Previously we determined the hypoxia-inducible protein Bnip3 is integral component of the mitochondrial death pathway that can signal apoptosis and autophagy but the precise mechanisms that differentially regulates these divergent processes remains cryptic. Herein, we provide novel evidence that inclusion or skipping of exon3 of Bnip3 mRNA by alternative splicing generates proteins with distinct and opposing actions on autophagy and cell survival. Metabolic stress imposed by hypoxia or nutrient deprivation resulted in the synthesis of two Bnip3 mRNA isoforms in post-natal ventricular myocytes in vitro and in vivo. Notably, one Bnip3 mRNA comprised of exons 1 through exon 6 encoded a protein of 26kDa, while a second mRNA generated by the fusion of exon2 and exon4 encoded a truncated Bnip3 protein of 8.2kDa. Sequence analysis revealed the truncated isoform encodes a conserved C-terminus domain that exclusively targets Bnip3 to the endoplasmic reticulum and not mitochondrion. While the 26kDa Bnip3 induced mitochondrial perturbations and autophagy, the spliced variant suppressed Bnip3- induced mitochondrial defects and autophagy. Furthermore, genetic knock-down or mutations within the C-terminus of the spliced variant defective for ER targeting sensitized cardiac myocytes to mitochondrial ROS production and death. To our knowledge our data provide the first direct evidence for a novel survival mechanism whereby the metabolic status of the cell programs autophagy or apoptosis by preferentially targeting Bnip3 isoforms to mitochondria or ER during metabolic stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,373
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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