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Enregistrement W2734087856 · doi:10.1002/2211-5463.12266

Regulation of <i>Neisseria meningitidis</i> cytochrome <i>bc</i><sub>1</sub> components by NrrF, a Fur‐controlled small noncoding <scp>RNA</scp>

2017· article· en· W2734087856 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueFEBS Open Bio · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesUniversity of OxfordWellcome TrustWellcome
Mots-clésNeisseria meningitidisRNABiologyRna processingComputational biologyGeneticsGeneBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NrrF is a small regulatory RNA of the human pathogen Neisseria meningitidis . NrrF was previously shown to repress succinate dehydrogenase ( sdh CDAB ) under control of the ferric uptake regulator (Fur). Here, we provide evidence that cytochrome bc 1 , encoded by the polycistronic mRNA pet ABC , is a NrrF target as well. We demonstrated differential expression of cytochrome bc 1 comparing wild‐type meningococci and meningococci expressing NrrF when sufficient iron is available. Using a gfp ‐reporter system monitoring translational control and target recognition of sRNA in Escherichia coli , we show that interaction between NrrF and the 5′ untranslated region of the pet ABC mRNA results in its repression. The NrrF region essential for repression of pet ABC was identified by site‐directed mutagenesis and is fully conserved among meningococci. Our results provide further insights into the mechanism by which Fur controls essential components of the N. meningitidis respiratory chain. Adaptation of cytochrome bc 1 complex component levels upon iron limitation is post‐transcriptionally regulated via the small regulatory RNA NrrF.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,035
Score d'incertitude au seuil0,951

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle