<scp>HLA</scp> haplotypes in primary sclerosing cholangitis patients of admixed and non‐European ancestry
Notice bibliographique
Résumé
Primary sclerosing cholangitis (PSC) is strongly associated with several human leukocyte antigen (HLA) haplotypes. Due to extensive linkage disequilibrium and multiple polymorphic candidate genes in the HLA complex, identifying the alleles responsible for these associations has proven difficult. We aimed to evaluate whether studying populations of admixed or non-European descent could help in defining the causative HLA alleles. When assessing haplotypes carrying HLA-DRB1*13:01 (hypothesized to specifically increase the susceptibility to chronic cholangitis), we observed that every haplotype in the Scandinavian PSC population carried HLA-DQB1*06:03. In contrast, only 65% of HLA-DRB1*13:01 haplotypes in an admixed/non-European PSC population carried this allele, suggesting that further assessments of the PSC-associated haplotype HLA-DRB1*13:01-DQA1*01:03-DQB1*06:03 in admixed or multi-ethnic populations could aid in identifying the causative allele.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».