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Enregistrement W2734448997 · doi:10.1139/cjb-2017-0056

Effect of GFP-tagging on nitrogen fixation and plant growth promotion of an endophytic diazotrophic strain of <i>Paenibacillus polymyxa</i>

2017· article· en· W2734448997 sur OpenAlexafffundvenue
Kiran Preet Padda, Akshit Puri, Qingwei Zeng, Chris P. Chanway, Xiao‐Qin Wu

Notice bibliographique

RevueBotany · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésDiazotrophBiologyInoculationPaenibacillus polymyxaNitrogen fixationStrain (injury)BotanyBacteriaHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Green fluorescent protein (GFP), a renowned marker protein, is typically believed to be inert with respect to affecting the physiology of the bacteria it occurs in. We analyzed the effects of GFP-tagging on the ability of an endophytic diazotroph, Paenibacillus polymyxa P2b-2R, to fix nitrogen and promote the overall growth of corn plants. The growth response and the amount of nitrogen fixed by P2b-2Rgfp-inoculated plants were compared with uninoculated controls and P2b-2R-inoculated plants at three harvests. P2b-2Rgfp inoculation significantly increased the biomass of corn plants as compared with non-inoculated controls and P2b-2R-treated plants. In-vitro tests revealed that strains P2b-2R and P2b-2Rgfp possess various plant-growth-promoting characteristics, namely phosphate solubilization, production of siderophores, indole acetic acid, ammonia, and enzymes such as cellulase, protease, and catalase. P2b-2Rgfp-inoculated plants fixed 18% atmospheric nitrogen, which was significantly higher than the P2b-2R-inoculated plants (15%). This difference led us to compare the expression of structural nif genes (nifH, nifD, nifK) of strains P2b-2R and P2b-2Rgfp. We observed that expression levels of structural nif genes of strain P2b-2Rgfp were 1.5-fold higher than those of strain P2b-2R. These results indicate that GFP-tagging positively affects the efficacy of strain P2b-2R with respect to promoting plant growth and fixing nitrogen, perhaps by increasing the expression levels of structural nif genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,182
Score d'incertitude au seuil0,219

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations37
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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