Investigations into molecular alterations present in ductal carcinoma in situ of the breast using a murine mammary tumor model
Notice bibliographique
Résumé
Proc Amer Assoc Cancer Res, Volume 46, 2005 1073 Ductal carcinoma in situ (DCIS), an alleged precursor of invasive breast cancer, is characterized by neoplastic epithelial cells growing within mammary ducts. One of the most critical stages in the development of breast cancer is the progression from DCIS to invasive carcinoma, when the basement membrane of the duct is breached and tumour cells spill out into the surrounding stroma. Clinical prognostication for DCIS is challenging, as the likelihood of progression to invasion by low-grade DCIS and the potential for low-grade lesions to evolve to high-grade both remain unclear. The small size of lesions, coupled with variations in time to invasion and rates of post-treatment recurrence, have complicated the study of DCIS in humans. The MMTV- neu 202Mul mouse model has been reported to develop DCIS-like lesions in the mammary fat pads. When a tumour is detected by manual palpation, the animal is sacrificed and the mammary fat pads are removed. Tissues are prepared as both snap-frozen and formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) blocks, sectioned, stained with haematoxylin and eosin, and assessed for quality. Immunohistochemical staining for smooth muscle actin (SMA) reveals the myoepithelial cells which are wrapped around the basement membrane of the ducts. Assessing the continuity of the myoepithelial cell line permits classification of tumours as either DCIS, invasive, or focally invasive. FFPE sections of DCIS and fully invasive samples are then microdissected. DNA is extracted and examined using array comparative genomic hybridization. Analysis has revealed differing patterns of genomic amplification and deletion between the two tumour types. Copy numbers of Gas6 and Psmb3 have been found amplified in invasive carcinoma. To assess gene expression levels, RNA is extracted from frozen DCIS and fully invasive tumours and analysed via expression microarray. Array profiling has revealed altered expression of genes including Tsga2 , Grb7 , Arl1 , and Phka2 . Preliminary data indicate that these genes have higher expression in DCIS. Gene copy number and gene expression differentials will be further analyzed using quantitative polymerase chain reaction (Q-PCR). Immunohistochemistry is being employed to develop a profile of the tumour types. Targets including Ki67, Laminin, Activated Caspase 3, E-Cadherin, and CD31 have been assessed. These data indicate differences in the expression of certain markers between tumour types. In comparison to DCIS tumours, invasive tumours have shown an increase in expression of Ki67 but a decreased expression of Activated Caspase 3. Additional immunohistochemistry is ongoing, as is collection and analysis of microarray data. Through comparison of data from mouse and human cases, we plan to identify a subset of genes which could be used as prognostic markers and/or therapeutic targets to improve clinical management of human DCIS cases.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».