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Enregistrement W2735098296 · doi:10.1136/bmjopen-2017-016300

Prevalence and antibiotic resistance of <i>Mycoplasma genitalium</i> among STI clinic attendees in Western Canada: a cross-sectional analysis

2017· article· en· W2735098296 sur OpenAlexafffundabout
Jennifer Gratrix, Sabrina S. Plitt, LeeAnn Turnbull, Petra Smyczek, Judith Brandley, Ron Scarrott, Prenilla Naidu, Penny Parker, Brenda Blore, Amy Bull, Sandy Shokoples, Lindsay Bertholet, Irene Martín, Max Chernesky, Ron Read, Ameeta E. Singh

Notice bibliographique

RevueBMJ Open · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensMcMaster UniversityUniversity of AlbertaProvincial Laboratory of Public HealthPublic Health Agency of CanadaAlberta Health Services
Organismes subventionnairesHologicAlberta Health Services
Mots-clésMedicineMycoplasma genitaliumCross-sectional studyAntibiotic resistanceFamily medicineEpidemiologyAntibioticsEnvironmental healthGynecologyMicrobiologyInternal medicineChlamydia trachomatisPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objectives To determine the prevalence and correlates of M ycoplasma genitalium (MG) infection among men and women, determine the prevalence of gene mutations conferring resistance and compare test performance of female specimen types. Methods A cross-sectional study was conducted on specimens collected for gonorrhoea (NG, Neisseria gonorrhoeae ) and chlamydia (CT, Chlamydia trachomatis ) among male and female Alberta STI clinic attendees using the M. genitalium transcription-mediated amplification-research use only test. Positive specimens were sequenced for 23SrRNA, parC and gyrA genes. Gender-stratified analysis compared test results using χ 2 or Fisher’s exact test, Mann-Whitney U test and logistic regression. Female endocervical and urine specimens were compared. Results A total of 2254 individuals were tested; 53.8% (n=1212) were male. Male prevalence of MG was 5.3%; CT was 5.9% and NG was 1.8%. Correlates of male infection were a non-gonococcal urethritis diagnosis and NG coinfection. MG prevalence for women was 7.2%; CT was 5.8% and NG was 1.8%. Correlates of female infection were younger age, Indigenous/Other ethnicity and CT/NG coinfection. Nearly two-thirds of eligible specimens had mutations associated with macrolide resistance and 12.2% of specimens had a parC mutation signifying possible moxifloxacin resistance. There was high concordance (98.1%) of results between urine and endocervical swabs. Conclusions The high prevalence of MG relative to CT and NG supports the incorporation of MG testing into routine sexually transmissible infection screening. The high rate of resistance to macrolides and moxifloxacin raises concerns about treatment options. The good concordance of results between urine and endocervical swabs supports the use of female urine specimens for testing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,520
Score d'incertitude au seuil0,700

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,416
Écart entre enseignants0,342 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2017
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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