MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2735282391 · doi:10.4049/jimmunol.198.supp.79.27

The QuickSwitch Quant HLA-A*02:01 Tetramer Kit can be used for determining the biological activity of a cancer vaccine.

2017· article· en· W2735282391 sur OpenAlexaff
Marc Delcommenne, Оlga Hrytsenko, Cynthia Tram, Genevieve Weir, Marianne M. Stanford

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensImmunovaccine (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTetramerPeptideHuman leukocyte antigenMajor histocompatibility complexChemistryAdjuvantMolecular biologyComputational biologyBiologyAntigenBiochemistryImmunologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract We have devised a fast and user-friendly assay (QuickSwitch™ Quant) that can both help determine binding of novel peptides to MHC class I molecules and generate new specificity MHC class I tetramers for peptide specific T cell detection. This study aimed to determine whether the QuickSwitch™ Quant HLA-A*02:01 Tetramer Kit can also be used for evaluating the biological activity of a vaccine. The tested vaccine was DPX-Survivac, an ovarian cancer vaccine candidate which consists of several survivin peptide antigens that are each restricted to a different human class I allele. We sought to evaluate the specificity and sensitivity of the QuickSwitch™ Quant HLA-A* 02:01 Tetramer Kit-PE for assessing the biological activity of SurA2.M, an HLA-A2-restricted peptide, in DPX-Survivac. The complete vaccine also contains non-HLA-A2 restricted peptides, lipids and a polynucleotide adjuvant. We tested the detection of the peptide prepared individually in a buffered solution or in the DPX-Survivac vaccine prepared in an aqueous formulation. Results indicate that peptide exchange rate of SurA2.M is similar whether it is dissolved individually in a buffered solution or mixed with other components of the vaccine. Results also may be dependent on the affinity of the peptide for HLA-A2. Thus, by optimizing a concentration curve using individual peptides, the QuickSwitch™ Quant HLA-A*02:01 Tetramer Kit can be used to quantify the concentration of HLA-A2 restricted peptides in simple solutions or more complex formulations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,048

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,329
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Immunology→Même sujetImmunotherapy and Immune Responses→Travaux en français237 207→