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Enregistrement W2735391963 · doi:10.1002/art.40207

Brief Report: Rare X Chromosome Abnormalities in Systemic Lupus Erythematosus and Sjögren's Syndrome

2017· article· en· W2735391963 sur OpenAlexaff
Rohan Sharma, Valerie M. Harris, J.W. Cavett, Biji T. Kurien, Ke Liu, Kristi A. Koelsch, Anum Fayaaz, Kaustubh S. Chaudhari, Lida Radfar, David M. Lewis, Donald U. Stone, C. Erick Kaufman, Shibo Li, Barbara Segal, Daniel J. Wallace, Michael H. Weisman, Swamy Venuturupalli, Jennifer A. Kelly, Bernardo A. Pons‐Estel, Roland Jonsson, Xianglan Lu, Jacques‐Eric Gottenberg, Juan‐Manuel Anaya, Deborah S. Cunninghame‐Graham, Andrew Huang, Michael T. Brennan, Pamela Hughes, Ilias Alevizos, Corinne Miceli‐Richard, Edward Keystone, Vivian P. Bykerk, Gideon M. Hirschfield, Gunnel Nordmark, Sara Magnusson Bucher, Per Eriksson, Roald Omdal, Nelson L. Rhodus, Maureen Rischmueller, Michael D. Rohrer, Marie Wahren‐Herlenius, Torsten Witte, Marta E. Alarcón‐Riquelme, Xavier Mariette, Christopher J. Lessard, John B. Harley, Wan‐Fai Ng, Astrid Rasmussen, Kathy L. Sivils, R. Hal Scofield

Notice bibliographique

RevueArthritis & Rheumatology · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSalivary Gland Disorders and Functions
Établissements canadiensUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesLupus Research InstituteNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésKaryotypeChromosomeX chromosomeMedicineCohortInternal medicineImmunologyGeneticsGastroenterologyGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Sjögren's syndrome (SS) and systemic lupus erythematosus (SLE) are related by clinical and serologic manifestations as well as genetic risks. Both diseases are more commonly found in women than in men, at a ratio of ~10 to 1. Common X chromosome aneuploidies, 47,XXY and 47,XXX, are enriched among men and women, respectively, in either disease, suggesting a dose effect on the X chromosome. METHODS: We examined cohorts of SS and SLE patients by constructing intensity plots of X chromosome single-nucleotide polymorphism alleles, along with determining the karyotype of selected patients. RESULTS: Among ~2,500 women with SLE, we found 3 patients with a triple mosaic, consisting of 45,X/46,XX/47,XXX. Among ~2,100 women with SS, 1 patient had 45,X/46,XX/47,XXX, with a triplication of the distal p arm of the X chromosome in the 47,XXX cells. Neither the triple mosaic nor the partial triplication was found among the controls. In another SS cohort, we found a mother/daughter pair with partial triplication of this same region of the X chromosome. The triple mosaic occurs in ~1 in 25,000-50,000 live female births, while partial triplications are even rarer. CONCLUSION: Very rare X chromosome abnormalities are present among patients with either SS or SLE and may inform the location of a gene(s) that mediates an X dose effect, as well as critical cell types in which such an effect is operative.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,761
Score d'incertitude au seuil0,777

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations48
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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