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Enregistrement W2735557810 · doi:10.4103/jpgm.jpgm_450_16

Evaluation of the association between a single-nucleotide polymorphism of bone morphogenetic proteins 5 gene and risk of knee osteoarthritis

2017· article· en· W2735557810 sur OpenAlexaboutno aff
AC Sharma, RN Srivastava, SR Srivastava, Anita Agrahari, Ajai Singh, Devendra Parmar

Notice bibliographique

RevueJournal of Postgraduate Medicine · 2017
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTGF-β signaling in diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineOsteoarthritisSingle-nucleotide polymorphismGeneBone morphogenetic proteinGeneticsPolymorphism (computer science)BioinformaticsGenotypePathologyAlternative medicineBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Osteoarthritis (OA) is a chronic degenerative disorder probably affected by both genetic and environmental causes. Bone morphogenetic proteins (BMPs) are bone-derived factors that can induce new bone formation. Single-nucleotide polymorphisms (SNPs) of BMP5 gene alters the transcriptional activity of the BMP5 promoter that has been involved in OA susceptibility. This case-control study investigated the association of rs1470527 and rs9382564 SNP of BMP5 gene with susceptibility to knee OA (KOA). MATERIALS AND METHODS: A total of 499 cases with radiographic KOA and 458 age- and sex-matched healthy controls were enrolled. Venous blood samples were obtained from all the cases as well as controls for polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism. RESULTS: The genotype distribution for rs1470527 and rs9382564 SNP was significantly different in cases and controls (P < 0.0001). Within both the SNPs of BMP5 gene, genotype CT and TT were significantly (P < 0.0001) associated with KOA as compared to the CC genotype. T allele of both the studied SNP was significantly associated with KOA (P < 0.0001). The allele frequencies of rs1470527 were 0.56(T) and 0.44(C) in cases and 0.33(T) and 0.67(C) in controls and in rs9382564 were 0.57(C) and 0.43(T) in cases and 0.71(C) and 0.29(T) in controls. Further in relation with clinical severity of OA, we observed signification association of TT genotype with both visual analog scale (P < 0.0001) and Western Ontario and McMaster Universities score (P < 0.05). CONCLUSION: Our results indicate significant association of rs1470527 and rs9382564 polymorphism of BMP5 gene with KOA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,259
Score d'incertitude au seuil0,482

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,269
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2017
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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